背景
隆武二年(1646年)八月，集於隆武朝廷旗下之南明諸軍，已先後為清軍擊敗，隆武政權岌岌可危。何騰蛟得到李自成軍50萬，十五日，清廷命恭順王孔有德為平南大將軍，率領懷順王耿仲明、續順公沈志祥、右翼固山額真金礪、右翼梅勒章京屯泰，率軍往征湖廣及兩廣，以徹底摧毀隆武政權。
過程
參見： 清滅南明隆武政權之戰
1646年形勢二十日，又命智順王尚可喜統所部協征。此次用兵，將以往以滿蒙八旗為主而改為以漢軍為主。九月，由浙江入閩的平南大將軍博洛所部，滅隆武政權。
十一月，明桂王朱由榔稱帝於肇慶，是為永曆政權。於是湖南明軍又於永曆旗下，繼續抗清。四年二月二十五日，孔有德部攻陷長沙，次日又陷湘陰，隆武朝湖南總督何騰蛟、總兵王進才撤走。孔有德遣梅勒章京卓羅、藍拜等追擊，將王進才部擊敗。
清軍偵知隆武朝平尚伯黃朝選擁眾13萬，屯於燕子窩。孔有德親率藍拜、屯泰等，由湘江水路進至淥口(今湖南株洲)，擊破屯於北岸的南明軍。乘勝追擊，於四月十二日攻占衡州(今湖南衡陽)，黃朝選降後被殺。智順王尚可喜、梅勒章京卓羅等由陸路進至渚州(今株洲)，遇南明總兵徐松節引馬步兵1.3萬逸去，便尾追，擊敗之。這時，南明總兵楊國棟乘長沙清軍兵力空虛，攻進長沙。孔有德急令懷順王耿仲明、固山額真金礪、梅勒章京卓羅等，率部由衡州走水路，疾回長沙。楊國棟率軍於城外天津湖阻擊清軍，被擊敗，遂由牛皮灘撤入城內，擁兵7000，水陸迎戰。
清軍擊敗楊國棟，重占長沙。之後，孔有德以長沙為基地，留固山額真金礪等守衡州，派遣兩路清軍占領湖南各地。西路由孔有德與懷順王耿仲明、梅勒章京卓羅率領，先破祁陽，殺南明總兵l員、副將1員、馬步兵7000。再克寶慶(今湖南邵陽)，斬南明軍3.2萬。
孔有德八月，清軍偵知南明永曆帝朱由榔據武岡，便連夜疾進。孔有德令梅勒章京黑成功、協領渥赫納等為前隊， 在武岡附近先破南明軍木城，斬南明監軍道1員、總兵以下將領100餘員、馬步兵1萬，後於夕陽橋擊敗明安國公劉承蔭所領1.8萬南明軍的攔截，劉承蔭降。當清軍進抵武岡時，朱由榔已逃離。南路清軍由智順王尚可喜、梅勒章京藍拜率領，趨桂陽(今屬湖南)。途中，偵知南明郝搖旗所部1400人，聚於翔鳳鋪，尚可喜令護軍統領線國安、協領蘇郎等，擊敗之。
當清軍進抵桂陽，原圍桂陽之南明軍已撤走。尚可喜便令藍拜等趨道州(今湖南道縣)，進攻郝搖旗部，郝部逸去；又遣線國安等趨靖州(今湖南靖縣)，追緝永曆帝朱由榔。時南明總兵肖曠、姚有性擁明軍1000、土司兵2000，據守靖州。清軍破城，生俘肖曠、姚有性。南明侍郎蓋光英等領土司兵1.4萬，進攻清營，欲奪回肖、姚，被清軍擊敗。接著，尚可喜率部趨沅州(今湖南芷江)，聞南明張憲弼部下分立五營於黔陽(今湖南懷化與會同之間，芷江東南)，便令藍拜等往圍黔陽。
結果
南明軍7000齣城迎戰，被清軍擊敗。八月間，清軍至沅州，張憲弼擁兵3萬，出城拒戰，被擊敗。清軍遂克沅州。二月至八月，孔有德率清軍基本上平定湖南。
