職責調整
（一）將原州水務局的職責劃入州水利局。（二）取消已由州政府公布取消的行政審批事項。
（三）取消擬定水利行業經濟調節措施，指導水利行業多種經營工作的職責。
（四）加強水資源的節約、保護和合理配置，保障城鄉供水安全，促進水資源的可持續利用。加強防汛抗旱工作，減輕水災害損失。
主要職責
（一）負責保障水資源的合理開發利用，擬訂水利發展規劃和計畫並組織實施，起草有關單行條例和規範性檔案草案，組織擬訂州管河湖的流域綜合規劃、防洪規劃。組織實施水利工程建設，提出水利固定資產投資規模、方向和財政性資金安排的意見，按規定許可權審核規劃內和年度計畫規模內水利固定資產投資項目,提出水利建設投資安排建議並組織實施。（二）負責生活、生產經營和生態環境用水的統籌兼顧和保障。實施水資源的統一監督管理工作，擬訂全州水中長期供求規劃、水量分配方案並監督實施，組織開展水資源調查評價和水能資源調查工作，組織實施取水許可、水資源有償使用制度和城鄉規劃及各類建設項目的水資源論證、防洪論證制度。指導水利行業供水和鄉鎮供水工作。
（三）負責水資源保護工作。擬訂全州水資源保護規劃和州內主要河湖水功能區劃並監督實施，按規定核定水域納污能力，提出限制排污總量建議，負責飲用水水源保護工作，監督指導地下水開發利用和城鎮規劃區地下水資源管理保護工作。
（四）負責節約用水工作。擬訂節約用水規劃和措施，監督執行相關政策和標準，指導和推動節水型社會建設工作。
（五）指導水利設施、水域及其岸線的管理與保護，負責州管河流、湖泊及河岸、灘涂的治理、開發建設，指導和監督水利工程建設與運行管理。
（六）負責防治水土流失。擬訂水土保持規劃並監督實施，組織實施水土流失的綜合防治、監測預報，按分工負責建設項目水土保持方案的審核、監督實施及水土保持設施的驗收工作，指導水土保持及有關生態建設項目的實施。
（七)指導農村牧區水利工作。組織協調農田、草原水利基本建設，指導飲水安全、節水灌溉等工程建設與管理工作，指導水利設施管理和社會化服務體系建設。指導州管河流、水能資源開發工作，組織實施水電電氣化和小水電代燃料工作。
（八）負責重大涉水違法事件的查處，協調、仲裁跨縣水事糾紛，指導水政監察和水行政執法。依法負責水利行業安全生產工作，負責對州管水庫、水電站大壩的安全進行監管，負責水利建設市場的監督管理，組織實施水利工程建設的監督。
（九）負責防治水旱災害，承擔州政府防汛抗旱指揮部的具體工作。組織、協調、監督全州防汛抗旱工作，對主要河湖和重要水利工程實施防汛抗旱調度和應急水量調度，編制防汛抗旱應急預案並組織實施，指導水利突發公共事件的應急管理工作。
（十）開展水利科技工作。組織開展水利行業質量監督工作，監督實施水利行業技術標準、規程規範。承擔水利統計工作。
（十一）承辦州政府交辦的其他事項。
內設機構
根據上述職責，州水利局設3個內設機構：（一）辦公室。
負責機關文電、會務、機要、檔案、政務公開、督查督辦、政務協調、安全保密、信訪等工作，承辦機關黨群和離退休人員管理工作；起草有關單行條例和規範性檔案草案；承擔機關規範性檔案的合法性審核工作；承辦行政複議和行政應訴工作；負責局機關及所屬單位的機構編制、人事管理、財務監管、國有資產管理、統計、職工教育培訓等工作；負責依法行政監督檢查、法治宣傳教育和執法考核等工作。
（二）規劃建設與科技水保科。
擬訂水利發展規劃，審核重大建設項目洪水影響評價和水利工程建設規劃意見書，組織審核、報批全州重點水利工程項目建議書和可行性研究報告；指導水利設施、河道、湖泊、水域及其岸線的管理和保護；組織水利建設項目初步設計審核和工程建設與驗收；指導水利工程建設管理，負責水利工程質量監督管理，指導水利工程開工審批、蓄水安全鑑定和驗收；指導重點建設項目和病險水庫除險加固工程的建設管理；指導水利建設市場的監督管理；負責水利科技工作；監督實施農村牧區水利政策、發展規劃和技術標準，組織協調全州農田、草原水利基本建設工作；指導農村牧區飲水安全、村鎮供水排水工作,指導實施農村牧區飲水安全工程建設；指導農田灌溉與草原灌溉工作,組織實施節水灌溉、雨水集蓄利用、灌區續建配套與節水改造、草原節水灌溉示範項目、泵站建設與改造工程建設,指導農村牧區節水工作；組織實施小型農田水利工程建設；承擔水土流失綜合防治；組織編制水土保持規劃並監督實施；負責開發建設項目水土保持方案的審核並監督實施；組織水土流失監測和上報工作。
（三）安全監督與水政水資源監察科。
承擔水利行業安全生產工作；承擔州管水庫、水電站大壩的安全監管,組織水利安全事故的調查；指導州管河流、湖泊及河岸的治理開發；組織指導河道采砂管理，指導河道管理範圍內建設項目管理有關工作，組織實施河道管理範圍內工程建設方案審查制度；指導監督全州水政監察和水行政執法工作；承擔重大涉水違法事件的查處；組織開展水資源調查評價和水能資源調查工作；編制水資源專業規劃並監督實施；監督實施水資源論證制度、取水許可制度和水資源有償使用制度；組織編制節約用水規劃，擬訂各行業用水定額並監督實施；指導地下水資源開發利用和保護工作；指導農村牧區水電電氣化和小水電代燃料工作；指導州管河流水能資源開發、小水電建設及管理工作；承擔州防汛抗旱指揮部辦公室的日常工作
