管轄部門
醫學院
截至2013年12月底，醫學院設有基礎醫學系、公共衛生學系、臨床醫學一系、臨床醫學二系、臨床醫學三系、口腔醫學系、護理系等7個院系。現有附屬醫院7家，其中附屬第四醫院（義烏）於2014年10月31日開診試運行。共有教職員工和醫護人員近16000人，其中中國科學院院士1人，中國工程院院士3人，國家“千人計畫”學者（包括“青年千人”）19人，“973”計畫和重大科學研究計畫等首席科學家8人，教育部長江特聘教授8人，國家傑出青年基金獲得者10人，教授及正高職人員近800人，博士生導師349人，碩士生導師815人。現有在讀醫學生約5000人（其中本科生約2500人，碩士研究生1300餘人，博士研究生1200餘人，留學生500餘人）。
學院以培養和造就醫學實踐、生物醫學研究和公共衛生事業管理的精英人才為使命，建有八年制醫學博士(臨床醫學）、五年制醫學本科（臨床醫學、口腔醫學、預防醫學）等專業，並在國內率先建立了四年制生物醫學本科新專業，開設了浙江大學首個也是唯一一個成建制留學生教育項目（五年制臨床醫學專業）。目前，擁有基礎醫學、公共衛生與預防醫學、臨床醫學、口腔醫學、護理學、藥學6個一級學科博士點，擁有5個博士後流動站。
近年來，學院圍繞國家戰略需求，注重學科頂層設計，統籌實施科研項目，加強基礎醫學向臨床醫療轉化，促進醫學與工、理等學科的交叉結合，著力推進浙江大學轉化醫學研究院和浙江大學醫學中心建設。學院的科學研究與科技創新水平持續提高，承擔國家重大戰略項目的能力不斷增強，目前擁有國家重點學科4個（內科學（傳染病學）、外科學（普外）、腫瘤學、兒科學），國家重點培育學科3個（眼科學、婦產科學、病理學與病理生理學），國家臨床重點專科45個，國家重點實驗室1個和省部級重點實驗室21個，建設有“醫學技術與疾病防控”985科技創新平台。科研經費不斷躍增，發表SCI收錄論文數躍居全國醫學院校前例，獲國家科技進步獎和科技發明獎16項（其中李蘭娟院士領銜的“重症肝病診治的理論創新與技術突破”項目榮獲2013年度國家科技進步一等獎），省部級獎項占浙江大學科研成果獲獎總數的1/3。
藥學院
浙江大學藥學院具有悠久的歷史和學術傳承，其前身浙江公立醫藥專門學校藥科和國立浙江大學藥學系分別成立於1913年和1944年，是國人最早創辦的現代藥學教育和高等藥學教育院系之一，為中國現代藥學和製藥科技的發展培養了大量專門人才和許多領軍人物。中國藥學會創始人之一趙橘黃以及於達望、張輔忠、曾廣方、陳璞等中國藥學會共7屆理事長，黃鳴龍、樓之岑、陳耀祖、池志強、金國章、洪孟民、李連達等8位院士先後在藥學院學習和任教。1999年，浙江大學藥學院依託四校合併後新的浙江大學的綜合力量組建成立。最近十幾年裡，藥學院秉承“明德弘藥”院訓，以“為人類健康，創一流藥學”為使命，創新辦學理念，整合資源，匯聚人才，實現了令人矚目的跨越式發展，已經躋身中國高校最優秀的藥學院行列。
藥學院現有教職工135人，其中教學科研崗54人，包括正高級職稱24人、副高級職稱24人，國家傑出青年基金獲得者2人、浙江大學求是特聘教授3人、國家百千萬人才工程1人、教育部新世紀人才6人、全國優秀教師2人。
學院現設2個學系、6個研究所、藥學實驗教學中心和1個國家藥監局藥物安全性評價中心（GLP）。藥物分析學為國家重點培育學科，藥物分析學和藥理學為浙江省重點學科。學院擁有全軍特種損傷防治藥物重點實驗室、浙江省小分子藥物研發關鍵技術創新團隊、浙江大學-巴黎高等師範學校藥物化學聯合實驗室、浙江大學藥學院-King`s College London聯合實驗室以及8個校企合作藥物研發中心。
藥學院教師人均科研經費和人均SCI論文產出均名列全國同類院校前列。歷年來共研製各類新藥30餘個，其中2個新藥3個品種被收入《中國藥典》。“中藥質量計算分析技術及其在參麥注射液工業生產中的套用”的科技成果榮獲2004年度國家科學技術進步獎二等獎，近十年來，學院共獲得國家級和省部級科技獎勵27項，承擔國家“十一五”重大科技專項重大新藥創製 “臨床前藥物代謝動力學技術平台”、“抗惡性腫瘤、心腦血管病和神經精神系統疾病新藥臨床前藥效學評價技術平台”和“中藥藥效物質基礎及物質資源庫研究關鍵技術”、國家自然科學基金重點項目、973、863等大項目；研製國家新藥20餘個，其中2個新藥3個品種載入中國藥典。
藥學院1913年開始招收三年制學生，1947年開始招收四年制本科學生，1978年開始招收碩士研究生，2001年開始招收博士研究生。百年來，藥學院在教育教學和人才培養方面取得了豐碩成果，共培養各專業各類畢業生4500餘名。目前學院設有藥學、中藥學2個一級學科及下屬7個二級學科，招收藥學、藥物製劑2個本科專業。學院現擁有藥學一級學科博士學位授權點和中藥學一級學科碩士學位授權點，招收藥物分析學、藥理學、藥物化學、藥劑學4個專業的博士研究生和藥學（包括專業學位）、中藥學專業的碩士研究生。
藥學院自成立之日起一直重視國際交流，近十年來，學院先後與美國、英國、日本、德國、法國、葡萄牙、義大利、比利時、瑞典、韓國、泰國等10多個國家的藥學院校和科研機構進行師生互訪、學術交流和合作研究，與20多所國外和境外大學及研究機構建立了友好合作關係。
學部領導
| 醫藥學部現任主任/副主任 | |
| 醫藥學部主任 | 段樹民 教授（中國科學院院士） |
| 醫藥學部副主任 | 陳忠 教授 |
| 醫藥學部副主任 | 管敏鑫 教授 |
