主要職能
一、貫徹執行黨的路線、方針、政策；研究擬定落實農業和農村經濟發展的產業政策的措施，引導農業產業結構的合理調整、農業資源的合理配置和產品品質的改善，發展現代農業和生態農業；提出有關農產品及農業生產資料價格、大宗農產品流通、農村信貸及農業財政補貼的政策建議；提出農業各產業的法律、法規、條例的建議，草擬農業主管產業規範性檔案，並組織實施和監督檢查其執行情況；負責農業主管產業的行政執法和行政複議工作。
二、研究擬定農業和農村經濟發展中長期規劃和區域開發規劃、項目規劃，經批准後組織實施；制定農業生產和農村經濟運行與調控方案；負責農業資源的區劃和耕地保養管理工作；參與指導、監督減輕農民負擔和耕地使用權流轉工作；在環境保護部門統一監督指導下，對農業環境保護工作實施具體監督管理。
三、對農業、農場和國家用於建設商品糧、棉、油、糖等生產基地的專項資金實行歸口管理；指導全市農業事業單位財務會計工作，監管專項資金使用情況。
四、調查了解農業生產情況，制訂增產、優質技術措施；負責糧、棉、油、茶、果、糖等商品生產基地建設，組織推廣高科技新品種和重大的先進適用技術，發展高產、優質、高效農業。
五、參與研究制定全市“菜籃子工程”的規劃，並負責瓜、果、菜等產品的技術、生產管理；研究農產品市場產銷方向，發布產銷信息，做好產前、產中、產後的服務工作；加強全市農業信息系統建設，管理農業信息，協同有關部門開展農業統計工作。
六、擬定農業各產業技術標準並組織實施；組織實施農業各產業產品及綠色食品的質量監督、認證和農業植物新品種的保護工作；組織協調農藥、種子和有關肥料等農業投入品質量監測、鑑定和執法監督管理；組織生產及進口種子、農藥、有關肥料等產品的登記，依法打擊生產銷售假冒偽劣種子、農藥、有關肥料等坑農害農行為。
七、擬定農業科技、教育規劃，實施科教興農戰略；組織重大科研課題的技術攻關和技術開發、示範和推廣；負責協調全市農業技術推廣體系建設；指導農業技術培訓、技術職稱評審、行業協會和農業職業技能開發工作；負責實施“綠色證書”工程和農業宣傳工作；指導“科技興村富農計畫”的實施。
八、承辦市政府授權的有關農業涉外事務，組織實施農業援助項目；組織有關對外經濟技術交流與合作。
九、會同有關部門管理國家和省、市農業主管產業資金投入；指導局屬單位的工作；監督局屬單位國有資產保值增值；按照許可權管理局屬單位幹部人事、勞動和社會保障以及機構編制等有關工作；指導有關社會團體為農業經濟發展服務。
十、組織、監督對市內植物的防疫、檢疫工作，發布疫情並組織撲滅；會同有關部門開展以農村自然災情調查和生產救災工作。
十一、完成市委、市人民政府交辦的其他事項。
內設機構
辦公室主要職責
協助局領導處理日常工作，綜合協調機關政務工作；負責起草綜合性報告、匯報材料和檔案，組織綜合性會議；組織新聞宣傳和調查研究；負責文秘、檔案、機要、保密、信訪、收發、房管、計畫生育、保衛等工作；指導全市農業系統檔案體系建設和局系統的檔案工作；負責本局重大事項和決定的督辦工作；擬定局機關有關規章制度，並負責督促檢查落實；抓好全市農業信息體系建設，預測並發布農村經濟信息；指導農業系統信息網路建設；協助局領導抓好抗災救災工作。
政工科主要職責
負責局機關和直屬單位幹部人事、機構編制和勞動與社會保障工作；負責職工的思想教育工作；負責農業系列專業技術人員和農民職稱評審有關工作；負責離退休人員管理服務工作；負責局機關黨委的日常工作。
紀檢監察室主要職責
協助局黨抓好黨風、廉政建設；負責黨員、工作人員黨紀、政紀教育；查處違紀違法行為；負責黨內監察工作。
政策法規與科技教育科主要職責
負責組織、協調並參與農業主管產業方面的規範性檔案的起草、修改工作；宣傳貫徹農村政策和涉農法規，並負責檢查監督落實，參與查處和糾正各級農業部門執法人員的違法或不當的行政行為；監督執行農業主管產業產品的技術和質量標準；負責清理本局規章或規範性檔案的廢除和規範性檔案的備案上報工作；負責指導全市各級農業部門的法制工作，承辦農業行政複議應訴工作；研究擬定農業科研、教育發展規劃、計畫和政策，並負責組織實施；承辦重點農業科技推廣項目的遴選及項目執行的管理工作；管理農業科技成果，組織實施開發利用；會同有關部門組織重大科研課題協作攻關；負責指導全市農業技術幹部的教育培訓及農業行業職業技能鑑定工作；承擔農學會的日常管理工作；負責實施“綠色證書”工程、“綠色電波入戶”工程、“科技興村富民計畫”和“跨世紀青年農民科技培訓”工程；協調監督農業生物物種資源保護和管理工作；協同管理農業主管產業的標準化、計量和質量工作；指導農業系統的質量認證工作，負責農業技術標準監測體系建設。
發展計畫與財務科主要職責
研究擬定農業中長期發展規劃、區域開發規劃、項目規劃和年度計畫並監督實施；歸口管理中央、省、市安排的各項專項資金和市直單位基建計畫的立項與申報工作；負責全市各類專項資金的匯總、上報工作；組織農業資源區劃工作；研究提出有關農業和農村發展的財政、稅收、信貸和保險的政策建議；指導農業行業和直屬單位的財務管理，負責局機關財務工作，監督直屬單位的國有資產管理；負責全市農業統計工作。
經濟作物科主要職責
研究擬定經濟作物的發展目標和中長期發展規劃；研究提出以經濟作物發展的政策建議；參與研究“菜藍子工程”的規劃、政策，抓好水果、蔬菜、甘蔗、烤菸、中藥材、花卉等經濟作物商品生產基地和良種生產基地的建設；調查分析經濟作物生產形勢和市場動態，提出總量平衡、結構調整、區域布局、產品加工、質量改進、效益提高和栽培方式改革措施；指導經濟作物產業化工作；負責園藝、茶葉等示範場的管理；做好經濟作物的產前、產中、產後的服務工作。
糧油作物科主要職責
研究擬定糧油作物近期目標和中長期發展計畫；研究提出糧油作物發展的有關政策建議；調查分析糧油作物生產形勢和開發動態，提出總量平衡、結構調整、區域布局、產品加工、質量改進、效益提高和耕作制度改革措施；抓好糧油生產基地建設；指導糧油作物產業化工作；組織協調糧油作物重大項目的實施和管理；研究擬定糧油生產的技術措施，總結推廣糧油高產栽培技術的經驗，推廣糧油作物高新技術和高新品種；抓好大面積生產及苗情工作；抓好專業培訓。
蔬菜科主要職責
負責全市蔬菜產業發展規劃的制訂,組織實施《湖南省城鎮蔬菜專業基地管理條例》，負責管理“菜籃子”工程建設和新菜地開發建設基金的徵收與使用，負責組織城鎮蔬菜生產、科研、流通工作，做好蔬菜基地建設、蔬菜生產、加工和新技術新品種的研究、引進、推廣工作；組織指導蔬菜產前、產中、產後服務，會同有關部門組織實施和監督檢查無公害蔬菜、淨配菜產銷標準，配合有關部門對全市商品蔬菜的質量進行檢測和監管，負責管理和安排省、市級蔬菜資金和物資，做好蔬菜業務報表。
永州市農業行政執法支隊職責
依法履行法律法規和規章明確規定由農業行政部門實施的農業資源和環境保護、農產品質量安全監管、農業智慧財產權保護等方面的執法監督檢查、行政處罰、行政強制等職責；負責跨縣區的重大案件、下級農業部門移送的和應當迴避的案件的查處工作；負責組織全市性農資打假、農產品質量安全監管、農業資源和環境保護、農業智慧財產權保護等執法行動；市農業局交辦的其他工作。
土壤肥料工作站主要職責
負責基本農田保護和耕地保養管理，農用肥料質量監管，土肥水資源監測和合理利用，土肥水技術開發、培訓、試驗、示範和推廣等工作。
農業技術推廣站主要職責
負責農業技術推廣體系建設與管理；農業技術培訓；農業新技術的引進、試驗、示範及推廣等工作。
國營農場管理站主要職責
負責農場管理、農場體制改革；南亞熱帶作物開發項目的申報與實施；農墾統計與信息；局屬單位安全生產等工作。
農業環境監測管理站主要職責
組織開展農業生態環境建設和農業環境監測；組織指導農業生產對農業環境污染的預防和治理；負責無公害水果等農產品的開發與管理；在環境保護部門統一監督指導下，對農業環境保護工作實施具體監督管理。
農業利用外資外經辦公室主要職責
負責農產品出口基地建設；組織引進外資開發項目；對外合作交流；抓好招商引資等工作。
湖南省農業廣播電視學校永州分校（加掛市場信息辦公室）主要職責
負責農業成人學歷教育；農民素質教育、農業實用技術培訓；農村基層幹部培訓等工作；組織擬定農產品市場和農資市場建設及管理方面的法規與政策建議，擬定建設規劃、項目計畫並組織實施；研究擬定農產品行銷發展規劃並組織實施；研究擬定農業經濟信息體系及農業信息化建設規劃；負責農產品質量安全工作的綜合協調、歸口管理和監督檢查及農業標準化、名牌農產品推薦送審工作，組織制定農業地方標準體系、檢驗檢測體系、認證認可體系建設規劃和項目計畫並組織實施。
種子管理站主要職責
負責農作物種子生產、經營、管理、質量監督檢測，查處種子違法案件等工作。
永州市植保植檢站主要職責
負責農業病蟲害預測預報；指導農作物病蟲害防治；農業有害生物檢驗檢疫；新農藥試驗、示範、推廣。
農產品質量檢驗檢測中心主要職責
負責國家和省授權範圍的農產品質量安全檢測；負責農業投入品檢驗檢測，為農業行政執法、農業投入品、產出品和農業環境的質量評價提供技術依據；為農產品質量安全認證進行檢測並提供技術依據；負責全市農產品質量檢驗檢測體系建設的業務指導、諮詢、服務；承擔市農業局和上級業務部門交辦的其他工作。
