台灣省台南民國五十年信徙集資增建客堂及齋堂各一所。民國六十年六月本定、開妙訪妙尼師鑒於寺堂年久失修,以及住眾增多,寮房不敷使用,經決議重建,民國六十叄年底完成大雄寶殿、兩廂,並重塑佛像,之後並再改建兩廂成二層式。善化寺目前寺廟外觀為北方宮殿式建築,「善化晨鐘」為昔日歸仁十景之一。
善化寺為積極推展法務工作,從民國六十五年成立慈母會,之後改名為念佛會,其所從事工作內容有講經、共修拜懺、贊佛助念、貧困救濟、道路橋樑維修、獎學金。於民國八十四年參加人數增加到一千四百多人,於是將念佛會名稱改為『善化寺慈善會』其各單位均隸屬在慈善會。