長期以來，我國城市醫院普遍存在著綜合性醫院多而不專、專科醫院少而不精的問題。綜合性醫院一直是沿著“大而全”的方向發展，其特點是：科系多、樣樣有、門門松。這種統一“模式”下建設起來的“全能醫院”嚴重束縛了專科技術的發展。依靠這種布局，用以解決常見病尚可，但是面對醫學科學日新月異的發展，一個醫院的一個專科的發展靠如此薄弱的人力、物力是很難有作為的。
隨著醫學科學的發展，臨床分科越來越細。這種實際需要和客觀可能之間的矛盾已經越來越突出，一些科系逐漸分離出來，發展成為獨立的專科醫院。精細分科是醫學進步的標誌，衛生行政部門和醫院管理人員有責任為這種分化和飛躍積極創造條件。
除少數大城市，我國專科醫院建設發展的速度不快，最早的專科醫院只限於傳染、結核、精神三種，後來才陸續有了兒童、婦產、口腔、耳鼻喉、眼科、腫瘤、腦科、職業病等專科醫院。在這些專科醫院中，只有少數醫院在發展專科技術、培養專科人才、進行科學研究等方面成為省內、市內或全國的龍頭醫院或技術中心，多數專科醫院仍然規模小、骨幹少、設備差、水平低，與綜合性醫院同類專科相比，還不具備競爭優勢。
在已開發國家，城市的專科醫院數目遠遠超過綜合性醫院（社區醫療除外）。近幾年來，隨著我國醫療衛生體制改革的不斷深化，一些中小醫院關停並轉。其中，部分醫院由綜合性醫院改為專科醫院，使專科醫院的數量猛增。由於專科醫院在資金和設備投入上相對較小，容易在醫療市場的夾縫中生存甚至脫穎而出，故專科醫院越來越多，規模越來越大，檔次也越來越高。估計這一勢頭還會持續，專科醫院的興建數量有可能超過綜合性醫院。作為衛生行政主管部門，應該有計畫、有步驟、有目的地做好巨觀調控工作，把現有的部分城市綜合醫院逐步改造成專科醫院，同時重點培植綜合性醫院裡的重點專科，使它們成為本地區同類專科的技術中心。
需要特別指出的是，專科醫院的建設受社會因素和疾病譜及其順位的影響較大。前幾年，出於傳染病院、結核和肺科醫院等專科醫院被嚴重削弱，以致在遇到突如其來的非典型肺炎流行時，各級政府和各級各類醫院都措手不及，各方面損失巨大。這一教訓是極為深刻的。
如何把握此類專科醫院的建設和發展是一個值得探討的重大課題。一方面，隨著預防醫學的發展、社會預防工作的加強、人民生活水平和健康水平的提高、各種傳染病有的被控制有的被消滅，傳染病院的任務量客觀上大大減少。當結核病的發病率像某些國家那樣已下降到萬分之零點幾的時候，結核病院的確正在逐漸失去它存在的價值。另一方面，新的傳染病又在不斷的出現，老的傳染病在特殊條件下有可能捲土重來。因此，正確的策略應是：保持少而精的疾控隊伍，儲備一定數量的後備隊伍，同時制度上創新，措施上完備。一旦出現緊急公共衛生問題，則招之即來，來之能戰，戰之能勝。對其他專科醫院，政府在及時而準確地做出科學預測和指導性意見的同時，要充分發揮市場的調節作用，讓市場決定該上的上，該撤的撤，該轉的轉。
專科醫院的特徵就是“專”，專科醫院的生命力也在於“專”。專科醫院就是要專科專治，專病專治，分工細，專業化程度高。突出的專科優勢和專家優勢是專科醫院的核心競爭力所在。
專科醫院的建設應該逐步實現以下目標要求：
第一，服務半徑要大。辦醫院，要計畫、規劃並要經常分析和策劃自己的服務半徑問題。中小型綜合性醫院應盯住社區，大型綜合性醫院和專科醫院應儘量擴大自己的服務半徑。專科醫院的專科優勢一旦形成，就會形成較大的服務半徑。因為，“酒香不怕巷子深”。
第二，技術水平要高。專科醫院的重要功能之一就是解決一般綜合性醫院解決不了的專科問題，所以專科醫院的診療水準一定要高，專業技術骨幹一定要出色甚至拔尖，學科帶頭人最好是本學科或分支學科的技術權威。
第三，醫療設備要精良。專科醫院一定要有較高的設備檔次，尤其是要確保專科設備的先進性。這是參與激烈的醫療市場競爭的必備條件。
第四，專業分工要細。要想實現專科醫院的“高”、“精”、“專”，必須強調明細分工。只有這樣才能在技術上“精益求精”。專科醫院要根據本學科的發展走勢和分支情況建立專業組和二級分科，床位分設，人員固定，使專業技術人員真正做到技術專長突出甚至“身懷絕技”，成為一個方面的專家。
第五，要加強科學研究。專科醫院應該加強基礎醫學和臨床實驗研究，建立必要的實驗室、研究室。目前，多數專科醫院基礎醫學理論研究工作相當薄弱，臨床醫學研究仍處於臨床觀察和病例分析的感性認識階段，不能系統地探索疾病本質。這一現狀應逐步改變。專科醫院應利用自己的優勢，兼顧科研工作，力爭多出成果。
第六，要有一定的教學設施。上規模、高層次的專科醫院應承擔高等醫藥院校的教學任務，並負有培養在職專科人才的任務，有條件的還要招收研究生。所以，醫院內應有電教室、圖書資料室等必要的教學設施，以使現代化的專科醫院成為教學和培養人的重點基地。
