政治體制
橫琴廉政辦將設綜合部、紀檢監察部、審計監督部、反貪污賄賂和反瀆職侵權部等4個部門。廉政辦各部門對內是橫琴新區的紀檢、監察、檢察、審計等內設機構，對上分別是珠海市紀委、監察局、審計局、檢察院派駐機構，接受橫琴新區黨委、紀委和市紀委的領導，業務工作分別由市紀檢、監察、審計、檢察等部門對口指導，廉政辦主任由市紀委委派。橫琴將不再單設紀檢、監察、檢察、審計等部門機構。
成立意義
如果按原來體制，在橫琴都要單獨設紀委、監察局、審計局、檢察院、預防腐敗局等部門，成立廉政辦後這些部門不再單獨設定，節省了人力、物力，精簡了機構。但廉政辦的部門對外接受上級對口部門的業務指導，同時也是上級對口部門的派出機構，這是橫琴廉政辦在體制機制上的創新。
廉政辦對紀檢、監察、檢察、審計等多個部門的職能進行整合，在懲治預防腐敗方面實現信息等資源的共享，形成“一個平台辦公，多雙手抓落實”的“一體化”防治腐敗格局，擺脫某一職能部門“單打獨鬥”防治腐敗的局面，各部門之間的聯繫和協調也更加緊密，利於凝聚反腐合力。
展望
橫琴廉政辦是一個“體制機制的聯合體，功能整合的試驗場，一體化工作的新平台”，橫琴新區要加大創新力度，借鑑港澳地區反腐敗的經驗，真正建成反腐倡廉工作的示範地區，其先進經驗也將在珠海其他地區推廣。
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紀檢監察
黨的紀律檢查機關和政府的監察部門行使的兩種職能。由黨的各級紀律檢查委員會，檢查和處理黨組織和黨員違反黨紀的案件，受理黨員的控告和申訴以及民眾對黨員的檢舉和控告。監察是政府部門，是專司監督檢查政府機構和政府系統公職人員的機關。
檢察
由檢察院承擔對貪腐案件的偵查及對公訴案件提起公訴(檢控)。審計 由國家授權或接受委託的專職機構和人員，依照國家法規、審計準則和會計理論，運用專門的方法，對被審計單位的財政、財務收支、經營管理活動及相關資料的真實性、正確性、合規性、效益性進行審查和監督，評價經濟責任，鑑證經濟業務，是一項具有獨立性的經濟監督活動。
