人物經歷
1994年 畢業於浙江大學化學工程系生物化學工程專業;
2001年 獲日本九州工業大學生物科學和生物信息學系博士學位;
2001至2004年 日本慶應大學先端生命科學研究所 博士後;
2004至2008年 美國Burnham醫學研究所 博士後;
2008年入選中國科學院先進工業生物技術創新基地“百人計畫”。
現任中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所研究員。
已在國內外發表論文50餘篇(包括Mol. Microbiol., J. Biol. Chem., J. Bacteriol., PNAS等國際重要刊物)。
研究工作
致力於開發代謝途徑設計及網路調試平台,發展代謝流量組和代謝組分析技術、以及代謝途徑和轉錄調控網路的比較基因組學重構技術等;研究重要模式及工業微生物代謝網路及其調控的分子機制,揭示各種調節機制的相互作用及對代謝流量的調控機理,為合理改造細胞代謝、最佳化微生物生產提供理論依據;並開展光合微生物的代謝工程與合成生物學研究,通過對結構元件和調控元件的功能最佳化及設計組裝,實現目標化合物的最佳化生產。
近期論文
1. Xiaoqun Nie,‡ Bin Yang,‡ Lei Zhang, Yang Gu, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang*. (2016) PTS regulation domain-containing transcriptional activator CelR and sigma factor σ54 control cellobiose utilization in Clostridium acetobutylicum. Molecular Microbiology, in press.
2. Deng Liu and Chen Yang* (2014) The nitrogen-regulated response regulator NrrA controls cyanophycin synthesis and glycogen catabolism in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Journal of Biological Chemistry 289: 2055-2071
3. Lei Zhang, Xiaoqun Nie, Dmitry Ravcheev, Dmitry Rodionov, Jia Sheng, Yang Gu, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang* (2014) Redox-responsive repressor Rex modulates alcohol production and oxidative stress tolerance in Clostridium acetobutylicum. Journal of Bacteriology 196(22): 3949-3963
4. Dongfeng Liu, Guomin Ai, Qingxiang Zheng, Chang Liu, Chengying Jiang, Lixia Liu, Bo Zhang, Yiming Liu, Chen Yang*, Shuangjiang Liu* (2014) Metabolic flux responses to genetic modification for shikimic acid production by Bacillus subtilis strains. Microbial Cell Factory 13(1): 40
5. Yongzhen Tao, Deng Liu, Xing Yang, Zhihua Zhou, Jeong K. Lee, Chen Yang* (2012) Network identification and flux quantification of glucose metabolism in Rhodobacter sphaeroides under photoheterotrophic H2-producing conditions. Journal of Bacteriology 194(2): 274-283.
6. Lei Zhang, Semen A. Leyn, Yang Gu, Weihong Jiang, Dmitry A. Rodionov*, Chen Yang* (2012) Ribulokinase and transcriptional regulation of arabinose metabolism in Clostridium acetobutylicum. Journal of Bacteriology 194(5): 1055-1064.
7. Lixia Liu, Lei Zhang, Wei Tang, Yang Gu, Qiang Hua, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang* (2012) Phosphoketolase pathway for xylose catabolism in Clostridium acetobutylicum revealed by 13C metabolic flux analysis. Journal of Bacteriology 194(19): 5413-5422.
8. Semen A. Leyn, Fang Gao, Chen Yang*, Dmitry A. Rodionov* (2012) N-Acetylgalactosamine utilization pathway and regulon in proteobacteria. Genomic reconstruction and experimental characterization in Shewanella. Journal of Biological Chemistry 287(33): 28047-56.
9. Yang Gu, Yi Ding, Cong Ren, Zhe Sun, Dmitry A. Rodionov, Weiwen Zhang, Sheng Yang, Chen Yang*, Weihong Jiang* (2010) Reconstruction of xylose utilization pathway and regulons in Firmicutes. BMC Genomics 11: 255.