人物經歷
1964年11月1日,楊子恆出生於甘肅省定西市通渭縣馬營鎮龍頭村 ,父親楊益當過國小教師,家中兄妹4人,他排行老二 。6歲進入銀灘國小就讀,國中就讀於離家8公里的通渭縣馬營中學 。
1980年9月,以定西地區第一名的成績考入甘肅農業大學 ,大二時參加甘肅省大學生英語競賽,獲得第一名。1984年7月獲得農學學士學位 。
1987年,獲得北京農業大學動物遺傳專業碩士學位,之後在北京農業大學動物科學系擔任講師。
1989年,進入北京農業大學攻讀博士學位。1992年,獲得北京農業大學博士學位,之後在北京農業大學動物科學系擔任講師,同年進入劍橋大學動物科學系,從事博士後工作(1992年-1993年) 。
1993年,進入倫敦自然歷史博物館動物科學系,從事博士後工作(1992年-1994年)。1994年,進入賓夕法尼亞州立大學分子進化與遺傳學院,從事博士後工作(1994年-1995年)。
1995年,進入加州大學伯克利分校綜合生物學系,從事博士後工作(1995年-1997年)。
1997年,在英國倫敦大學學院從事進化和統計遺傳學教學研究工作, 歷任Galton 實驗室生物系講師(1997年-2000年)、進化遺傳學高級講師(2000年-2001年)、統計遺傳學教授(2001年-2010年)、R.A. Fisher 統計遺傳學教授(2010年-) 。
2005年,楊子恆加盟中國科學院動物研究所海外創新團隊 。
2006年,當選為英國皇家學會院士,是獲此殊榮的首位大陸旅英華人 。
2007年8月23日,中國科學院動物研究所計算與進化生物學研究中心在北京成立,楊子恆教授出任研究中心主任 。 同年入選教育部第9批“長江學者獎勵計畫”講座教授 。
2010年,擔任倫敦大學學院遺傳進化與環境系R.A. Fisher 統計遺傳學教授。
2015年,入選國家“頂尖千人計畫”,是中科院引進的唯一一位頂尖人才 。
2017年,進入哈佛大學拉德克里夫高等研究院從事科研工作(至2018年) 。
主要成就
科研成就
科研綜述
楊子恆的研究方向包括物種分化時間的貝葉斯估計,遺傳密碼子替換模型和適應性進化的檢測,近緣物種種間、種內資料的分析,物種識別等。他提出大量的用於分析分子水平上進化過程的統計模型和計算算法,對分子系統學的成熟有所貢獻,他開發的PAML軟體被廣泛使用 。
截止到2015年,楊子恆出版專著兩部,國際學術刊物上發表學術論文150餘篇,據LabTimes雜誌2006年統計,他是英國進化生物學界引用次數最高的科學家 。
出版專著
出版時間 | 圖書名稱 | 出版社 |
2006 | 《Computational Molecular Evolution》 | Oxford University Press |
2014 | 《Molecular Evolution: A Statistical Approach》 | Oxford University Press |
代表論文
1. Zhu T, dos Reis M, Yang Z. 2015. Characterization of the uncertainty of divergence time estimation under relaxed molecular clock models using multiple loci. Systematic Biology 64:267-280.
2. dos Reis M, Zhu T, Yang Z. 2014. The impact of the rate prior on Bayesian estimation of divergence times with multiple loci. Systematic Biology, 63:555-565.
3. Yang Z, Rannala B. 2014. Unguided species delimitation using DNA sequence data from multiple loci. Molecular Biology and Evolution, 31:3125-3135.
4. Zhang C, Rannala B, Yang Z. 2014. Bayesian species delimitation can be robust to guide tree inference errors. Systematic Biology, 63:993-1004.
5. Z. Yang, Molecular Evolution: A Statistical Approach (Oxford University Press, Oxford, England, 2014), 512 pages.
6. Yang Z., Rannala B. 2012. Molecular phylogenetics: principles and practice. Nature Review Genetics 13: 303-314.
7. Yang Z. and B. Rannala . 2010. Bayesian species delimitation using multilocus sequence data. PNAS 107: 9264-9269.
8. Yang, Z. 2007. PAML 4: Phylogenetic analysis by maximum likelihood. Mol. Biol. Evol. 24: 1586-1591.
9. Yang, Z., W.S.W. Wong, and R. Nielsen. 2005. Bayes empirical Bayes inference of amino acid sites under positive selection. Mol. Biol. Evol. 22: 1107-1118.
人才培養
2005年楊子恆加盟中國科學院動物研究所海外創新團隊隊後,開始在中國科學院大學聯合培養的碩士、博士,根據中國科學技術信息研究所、國家工程技術數字研究館信息、全國圖書館參考諮詢聯盟,培養學生信息如下 :
時間 | 名稱 | 作者 | 學位 |
2016 | 鬆弛分子鐘下系統發生樹定根與多物種溯祖模型下物種樹估計成效的計算模擬研究 | 許博 | 博士 |
2015 | 基於基因組數據檢測與估計物種形成過程中基因流的研究 | 劉俊鋒 | 博士 |
2013 | 鬆弛分子鐘下系統發生樹定根的模擬研究及進化分析軟體的圖形界面設計 | 許博 | 碩士 |
2012 | 進化遺傳學中的貝葉斯推斷 | 張馳 | 博士 |
榮譽表彰
時間 | 獎項/榮譽 |
2010年 | 英國動物學協會Frink獎章(Frink Medal for British Zoologists) |
2009年 | 皇家學會歐勝研究優秀獎(Royal Society Wolfson Research Merit Award) |
2008 | 終身成就總統獎(Presidents' Award for Lifetime Achievement) |
2006年 | 皇家科學院院士(Fellow of the Royal Society) |
1995年 | 美國自然主義者協會青年調查員獎(Young Investigator’s Prize from American Society of Naturalists) |
參考資料來源: |
社會任職
時間 | 擔任職務 |
2017年10月25日 | 北京師範大學名譽教授 |
2014年- | 《Philosophical Transactions of the Royal Society B》Editorial Board Member |
2011年-2013年 | 《Biological Letters》Editorial Board Member |
2006年-2008年 | 《Molecular Biology and Evolution》Associate Editor |
2005年- | 《Evolutionary Bioinformatics》Associate Editor |
2002年-2007年 | 《Genetics》Associate Editor |
2001年-2004年 | 《Systematic Biology》Associate Editor |
1998年-2002年 | 《Journal of Molecular Evolution》Associate Editor |
人物評價
楊子恆是國際進化生物學領域最有影響力的學者之一,其開發的用於分析分子水平上進化過程的統計模型和計算算法被國際學術界所廣泛採用,開發的PAML和BPP等軟體被廣泛使用,對進化生物學的發展做出了重大貢獻 。 (系統生物學學會評)