車站位置
植物園站位於天河區天源路華南植物園正門附近地底，地面為天源路、華南植物園及各住宅小區，附近有天源路總站。地下一層為站廳，設有售票機、客務中心和商店，地下二層為廣州捷運6號線的站台。附近公交站為捷運植物園站（世紀綠洲）。
植物園站月台吊板 
植物園站大字壁 車站站台
車站站台位於地下二層，為雙島式站台。廣州捷運6號線的兩條軌道位於中間，並在車站西南設一條單渡線，供必要時折返用。車站東北設定兩條聯絡線。
目前車站站台表現為側式站台，6號線在列車前進方向的右門下車。
| 軌道 | |
| 站台 | 島式站台 |
| 軌道 | ← 廣州捷運6號線 往 潯峰崗站 方向 下一站：長湴站（右側車門打開） |
| 軌道 | 廣州捷運6號線 往 香雪站 方向 下一站：龍洞站（右側車門打開）→ |
| 站台 | 島式站台 |
| 軌道 |
乘車信息
| 往 潯峰崗站方向 | 往 香雪站 方向 |
| 首班車時間：6:12| 末班車時間：23:12 | 首班車時間：6:00 | 末班車時間：23:35 |
| 上一站：龍洞站 | 上一站：長湴站 |
| 下一站：長湴站 | 下一站：龍洞站 |
出入口位置
目前植物園站共設有A、B、C、D、F、G共六個出口，分別位於天源路兩側。
A口
位於華南植物園正門右側，附近公交站為植物園站（東行）。設有垂直電梯等無障礙設備。
B口
位於世紀綠洲正門門前，設有自動扶梯。
C口
位於世紀綠洲北門附近，附近公交站為捷運植物園站（世紀綠洲）（東行）。設有自動扶梯。
D口
位於天源路與迎龍路的交界處，附近公交站為捷運植物園站（世紀綠洲）（西行）、龍洞路口站。設有自動扶梯。
F口
位於廣州市八十九中學附近。設有自動扶梯。
G口
位於寶翠園東南門附近，附近公交站為植物園站（西行）。設有自動扶梯。
為何飛站
記者從廣州捷運處了解到，柯木塱站和植物園站確實無法與廣州捷運6號線二期全線同時開通。“位於柯木塱村地塊內的柯木塱站的3個出入口及1組風亭，還有位於天源路南側的君林天下社區和世紀綠洲社區的地塊內植物園站，3個出入口和2組風亭，都因徵（借）地拆遷的問題，至今仍無法進場施工。” 捷運一名工作人員解釋。
據悉，風亭是捷運站內通風保障。按照消防要求，有2個出入口就可以開通捷運站，但風亭則一個不能少。作為重大市政工程，除非特殊原因，捷運規劃一般難以修改。另外，風亭建設還要兼顧環評要求，不能靠居民區太近，因此風亭的選址沒有很多選擇餘地。
捷運公司稱，捷運建設的一大難題便是徵（借）地拆遷。由於拆遷工作由政府相關部門協調，因此捷運公司方面也不知具體協商失敗的原因。“這兩站何時能開通，取決於徵（借）地拆遷的進展，因此現在無法預計開通時間。目前正與各方共同努力、加強協調，一旦場地交付捷運施工方即加緊施工，爭取早日開通。”該工作人員稱。
