職能調整
（一）劃出的職能：參與制訂環境保護產業政策和發展規劃
1、貫徹執行國家、省、嘉興市環境保護的方針、政策、法律、法規；受市政府委託對重大經濟和技術政策、發展規劃以及重大經濟開發計畫進行環境影響評價。
2、組織制訂和監督實施環境保護規劃及本市確定的重點區域、重點流域污染防治、生態保護計畫；編制環境功能區規劃；制定污染物排放總量控制計畫及相關政策；審核各鄉鎮城鎮總體規劃中的環境保護內容；參與編制本市可持續發展綱要。
3、監督管理大氣、水體、土壤、固體廢物。
（二）劃入和新增的職能：
1、農村生態環境保護；
2、機動車污染防治監督；
3、放射性同位素套用、光污染、電磁輻射的環境監督管理；
4、管理和組織協調環境保護國際條約國內履約活動；
5、生物技術環境安全；
6、組織推行ISO14000環境管理體系的認證工作。
（三）委託給直屬事業單位的職能：環境監測、監理工作。
主要職責
1、貫徹執行國家、省、嘉興市環境保護的方針、政策、法律、法規；受市政府委託對重大經濟和技術政策、發展規劃以及重大經濟開發計畫進行環境影響評價。
2、組織制訂和監督實施環境保護規劃及本市確定的重點區域、重點流域污染防治、生態保護計畫；編制環境功能區規劃；制定污染物排放總量控制計畫及相關政策；審核各鄉鎮城鎮總體規劃中的環境保護內容；參與編制本市可持續發展綱要。
3、監督管理大氣、水體、土壤、固體廢物。
內設科室
生態輻射科工作職責：1、組織編制並實施全市自然生態保護規劃、生態功能區區劃和流域區域環境保護規劃，加強城鄉生態環境建設保護，承擔生態市建設領導小組辦公室日常工作，負責生態鎮、生態村的創建，組織推動生態市建設工作。2、負責全市電磁輻射、核技術套用、光污染、伴有放射性礦產資源開發利用的輻射環境污染防治和監督管理，對核與輻射污染事件實施應急處置與調查等工作。
辦公室工作職責：1、組織協調局機關日常工作；2、承辦綜合性會議、文電、秘書、保密、檔案、信息、等政務工作；3、組織制定機關內部規章制度；4、負責局機關行政、後勤、財務、衛生和安全保衛及局系統信息管理；5、負責局機關和直屬單位機構編制和人事管理工作；6、規劃和組織環境保護系統在職人員培訓教育；7、辦理局機關、直屬單位人員出國政審；8、管理局機關退休人員；9、指導直屬單位科技人員專業技術職務評聘工作；10、承辦上級部門和本局領導交辦的其他事項。
環境管理科
法規宣教科
行政許可科
監察室
