種子含水量決定了儲藏方法。因此根據種子安全含水量的高低，我們把種子的儲藏分為乾藏和濕藏2類。
1 乾藏法
將充分乾燥的種子，置於乾燥的環境中儲藏稱為乾藏。這種方法要求有一定的低溫和適當乾燥的條件。適用於安全含水量比較低的種子，如大部分針葉樹種和楊、柳、榆、桑、樺、刺槐、白蠟、紫穗槐、皂莢、桃、李、杏等樹種的種子。
乾藏又分為普通乾藏法和密封乾藏法2種。
(1)普通乾藏法。把經過充分乾燥的種子，裝入麻袋、籮筐、箱、桶、缸、罐等容器中，置於低溫、乾燥、通風的庫內儲藏(可藏於倉庫、普通房間、地窖或專門的種子庫房內)的方法。適用於大多數針、闊葉樹種的種子短期儲藏(如秋采、冬儲、春播)。
(2)密封乾藏法。將充分乾燥到安全含水量的純淨種子，裝入已消過毒的容器內並密封儲藏的方法。主要適用於需要長期儲藏的和用普通乾藏法容易失去生活力的種子，如楊、柳、桉、落葉松等。這種方法使種子與外界空氣隔離，因而種子能夠經常保持乾燥狀態，呼吸作用很微弱，儲藏效果良好。
儲藏時，將種子放入玻璃瓶或鉛桶、鐵罐、聚乙烯容器中，裝九成滿，為防止種子吸濕，容器中可放人木炭、氯化鈣、變色矽膠等吸濕劑，然後加蓋，用石蠟、火漆黏土等密封，附以標籤、置於種子庫內。放置吸濕劑的數量，因樹種和吸濕劑的種類而異。
長期儲藏大量種子時，為了做到安全儲藏，應建造專門的種子庫。目前我國已經建造了許多低溫種子庫，控制溫度在一5～5℃，相對濕度在40%～60%，儲藏種子效果較好。
2 濕藏法
將種子置於濕潤、低溫、通氣條件下儲藏稱為濕藏。此法適用於安全含水量高的種子，如櫟類、核桃、銀杏、紫杉、檫樹、樟樹、油桐、油茶、油棕等樹種的種子及楊、柳的插穗等。
濕藏期間，要求環境條件：經常保持濕潤，以防種子失水乾燥；適度低溫，以O～5℃為宜，一般不能高於7℃，以防黴菌活化，抑制種子發芽；通氣良好，使種子周圍二氧化碳及時排除，新鮮氧氣滿足供給。
濕藏方法很多，主要有露天埋藏和室內堆藏法。
