概述
東方世紀末是根據東方人物北斗化的二次設定，在這部作品中幻想鄉化作核武火炎的地獄，
序
1XXX年12月於幻想鄉爆發的核災難，後世稱其為“灰色聖誕節”。巨大的毀滅之力使湖水枯竭，山巒破滅，刻在地面上的裂縫如同這個世界所遭受的痛苦一般，過去的文明毀於一旦，然而生靈們卻並沒有因此而滅亡，少數的人類、精靈以及各種妖怪在八雲紫所創造的隔離境界中倖存了下來，活在這完全由暴力支配的世界裡。
過去的規則被完全打破，人類也成為了各種生靈的食餌，由於強大妖怪支配力的消失，原本弱小的妖怪開始稱霸一方，因為各自為政所產生的部族戰爭也時有發生。直到19XX年，由於隔離境界的逐漸削弱，人類以及更多的妖怪得以重見天日，混亂的狀況卻更加嚴重了。然而，新的希望也悄悄地從現界流進了幻想鄉。
地理環境的變化使得核災難後的彈幕規則發生了重大的改變，首先飛行能力變成了少數人的專利，而且原本輕而易舉能夠放出的彈幕，現在必須依靠符卡才能極其有限的使用，所以SC成為了廢土幻想鄉里十分重要的“貨幣”，不過，沒有了強者保護的人類依舊只能任由妖怪宰割，直到一位傳說的賢者發現了名為《北東神拳》的秘籍，這是能幫助人類戰勝妖怪的最後希望。
北東神拳又分為“北斗”、“南斗”、“元斗”三個支流派系，一時間，男女老幼都選擇適合自己的流派刻苦修煉。妖怪們見人類變得不再那么好對付了，便也紛紛效仿這種拳腳之技，最終形成了獨具幻想鄉特色的各種分支流派，其中特別以南斗的流派為眾。拳法與各種現代兵器的流入使妖怪與人類間的平衡有了希望，終於，在199X年，天河中兩枚耀眼的啟明星出現了。
劇情簡介
199X年，在混沌的廢土幻想鄉之上，兩名世紀末的救世主終於誕生了。代表妖怪的——橙，以及代表人類的——東風谷早苗，她們為著各自的理想和目標孤獨地踏上了旅途，在群星的指引下終於交匯在了一起，成為了黑暗世界最耀眼的雙星。
“原本幸福的生活，突然間分崩離析”，直到八雲藍突然離開52隔離區，橙才真切的體會到這樣的故事若是發生在自己身上，是多么的不幸。
擅自打開隔離區是重罪一條，管理者風見幽香從小就這樣教育著52隔離區的孩子們，所以橙除了強迫接受主人離開的事實外，還得遭遇大家的白眼，這對於乖孩子來說是從未有過的經歷。逃出隔離區獨自尋找主人的橙，從銀河廣播電台台長射命丸文那裡打聽到了藍大人的線索，不料遇到的竟是南斗聖拳殉星——魔理沙，兩人在激鬥中分出了勝負，然而八雲藍似乎並不在魔理沙手中，而她也僅僅是為了治療心愛的少女才到處偷盜稀世珍藥。
暫別魔理沙後，橙有些茫然，此時附近村落出現的“有角族”引起了她的注意。在調查中，橙結識了同樣在尋找主人的東風谷早苗，兩人意氣相投，一拍即合，終於查清了所謂的“有角族”實際上是迷失於殘岩竹林的南斗仁星——上白澤慧音。
恢復正常的慧音將聖帝的惡行告訴了橙與早苗：原來，慧音雖然失去了視力，殘留的武藝尚且能擊退來犯燈火小鎮的兇惡妖怪。可就在最近，聖帝為了修建“極星地靈殿”祭奠師父，下令懸賞捕捉人類小孩以作貢品，大量的暴徒無時不刻襲擊著小鎮，甚至有村民公然進行金錢交易，這讓喜歡小孩子的慧音心疼不已。為了履行一名人民教師的責任，慧音對聖帝手下的流氓團體說“不”，卻不慎落入了聖帝的陷阱，這些天一直處於獸化狀態，無法復原。
不僅如此，慧音還說出了不久前於荷取重工舊址附近發現妖狐的情報，兩人商量了一下，決定先去尋找八雲藍的下落，畢竟人多好辦事，況且根據現在的情報，她們還沒有十足的把握與聖帝抗衡。
荷取重工的舊址在一片沙漠之中，雖然早已沒有了一絲水的跡象，但這裡卻突兀的豎立著幾根破損的冰柱，實在是在明顯不過的路標。正當橙和早苗準備闖入地下密室的時候，直升機的轟鳴聲讓她們警惕起來，待那群面露兇相的變種妖怪進入後，這才趕緊跟上。
密封艙室里，只見八雲藍正和為首的大妖精爭吵著什麼，還未等橙有所作為，兩桿冰冷的槍管悄無聲息的頂在了她們身後。見此狀況的藍義無反顧的激活了密封艙里的輻射，早苗和橙則乘機用必殺拳法幹掉了因大妖精遇難而發愣的妖精部下，可是密封艙已經無法再開啟了。
找到了藍大人卻無法再與她相見，看到那漸漸倒下去的身影，橙的心中充滿了怒火。彌留之際，八雲藍告訴她們去尋找一艘名叫星蓮船的天之方舟，船上的河城荷取，是幻想鄉重生的希望。回到燈火小鎮，兩人得到了慧音已被聖帝抓走的壞訊息，而且她正是曾經救過橙的恩人。新仇與舊恨堅定了她們與聖帝決一死戰的信念。
幾天后，橙與早苗到達了聖帝所統治的城鎮——核彈鎮。廣場中央插著一枚巨大的，尚未引爆的核彈，這似乎是這個鎮出名的原因。此時小鎮裡似乎在舉行著什麼活動，一打聽才知道是聖帝所舉辦的Queen’s Boxing比武大會，勝利者將能夠與聖帝直接對決，要是還能勝利，便可以直接取代聖帝接管她全部的財富。
兩人一路過關斬將，無人能敵，可惜她們的招數在與聖帝對決前就全部暴露了出來，所以這一戰對聖帝，橙與早苗慘敗。聖帝說要把失敗者扔進河裡餵青蛙，然而有群星守護著的兩名救世者，是不會這么簡單就殞命的！！！
醒來之後，橙發現自己身處好似神社的建築之中，早苗也在一旁，和她有同樣的疑問。原來，救了她們的不是別人，正是江湖上人稱“神醫二姨”的博麗靈夢。在核災難中，靈夢似乎並沒有躲過核輻射的污染，此時她原本烏黑的長髮已褪作銀灰，面容卻多了幾分柔和，這大概是因為她長久以來將力量用作醫治病人，心境也發生了改變。靈夢告訴橙和早苗，她的生命已經所剩無幾了，未來還得交給這兩位年輕人，況且她現在得一個人獨守大結界，脫不開身去退治聖帝，不過，靈夢答應教給二人擊敗聖帝的方法。
在靈夢式地獄修煉後，橙終於掌握了北斗博麗流的最終奧義——夢想天生，早苗固有的拳法雖然是南斗派系，但經過特訓也學會了更多制敵之法以及弱化版的——博麗夢想幻顏拳。
再戰聖帝，這次甚至連聖帝軍的死對頭——鬼軍都來幫主角們掃清障礙，此時的聖帝正在舉行極星地靈殿落成儀式。地靈殿頂層，十字陵下，被聖帝百般蹂躪的慧音毫不退縮，為了人們的生命，為了孩子們的未來，她一人將千斤重的陵頂頂於頭上，一步一步爬上地靈殿頂，十字陵最高處。若是有半點閃失，那些村民們就會被殺害，慧音絕不想看到這樣的結果。
在大義的鼓動下，前來營救慧音的勇士們大破聖帝軍，而早苗與橙也再度站在了聖帝的對面。然而，聖帝的身體秘密依舊沒能破解，橙的拳法毫無用武之地，早苗也深受重創，關鍵時候，一個人物的出現打破了即將降臨的死星，那正是聖帝靈烏路空的師父——藤原妹紅。
原來，阿空在習得蓬萊鳳凰拳最終奧義時，曾經與妹紅進行過對決。當時阿空所釋放出的恐怖力量甚至將妹紅分解成了原子，然而她卻不知道妹紅是不死者。妹紅意識到繼續放任下去可能會造成大害，於是她隱藏了起來，想讓阿空認識到自己必須嚴格的控制力量，可是事情並沒有那么簡單。阿空對於妹紅的養育之恩以及師徒之情的看重，是妹紅過去一直避諱的，她不會想到自己的消失會給前者帶來多么深的打擊。所以，當她再度甦醒，聽說阿空已經成為了無情的聖帝，這才追悔莫及。至少能救下過去的友人慧音也好，妹紅這樣想著，一路追來，最終還是趕上了。
不願承認自己被欺騙的聖帝阿空斷定眼前的這個師父是假的，然而內心裡卻方寸大亂，破綻百出，終於被橙的秘奧義“境界滅殺”所擊墜，失去了身為鳳凰最後的驕傲。號稱“不需要愛”的聖帝最終敗給了愛，早苗只得如此感嘆。
一個月後，橙與早苗再度見到了現居於核彈鎮的慧音和妹紅，此時卻是一副“一家三口其樂融融”的樣子。阿空雖然失去了大部分力量和聖帝的身份，卻解開了心結，再也不是一副哀怨的神情了，現在的她不僅有師父相伴，還有另一位關心她的老師，雖然後者比較刻板。
從阿空口中得知，星蓮船會每隔一段時間停留核彈鎮補給食物和生活用品，下次來這邊大概是一星期後。由於閒來無事，再加上受到了鬼軍首領古明地覺的邀請，橙和早苗也加入了追擊聖帝軍殘黨的任務中，這次鬼軍不僅出動了力之將軍，人稱“拳王”的勇儀，連戰略型兵器——巨大化萃香都用來開道。
兩軍一路你追我趕，最後竟來到了荷取重工舊址，在鬼軍壓倒性鎮壓下，聖帝軍終於全軍覆沒。鬼軍將聖帝軍私藏的數萬噸金坷垃全部發放給了人民，世界糧價迅速下跌，這下誰都吃得起飯了。
事情完結後，橙說想再去看看藍大人，遂同早苗一起下到了密室里。冷不防的，橙與一個正要上來的人迎面相撞，那人竟是本該氣絕的八雲藍！
驚訝之餘，藍告訴了橙，原來她的身體早就經過了機械化改造，是不怕核污染的。當時她為了讓橙離開，也不想讓橙覺得害怕，所以才故意裝作受到了輻射。現在，設施已經自行清理乾淨了污染，她也能夠打開密封艙了，本想即刻啟程去找兩人的，沒料到竟毫不費功夫。
橙喜極而泣，連忙表明自己不會討厭現在的藍大人，也不會覺得現在的藍大人和以前有什麼不同，藍也露出了久違的微笑。
之後，三人商定了未來的去向，果然還是一起登上星蓮船，一來可以藉助荷取的力量恢復幻想鄉的水源，二來亦可能找到八坂神奈子的蹤跡。
一切都只能靜待一周之後，不過希望之光就在那天之方舟上，無論如何都要前進！
主要人物
健次橙灰色聖誕節之後便和主人八雲藍一同生活於52隔離區，之後離開隔離區，一路瘋狂練級並且遇到好幫手早苗，最終成為了一名世紀末救世主，並接受藍的認可，獲得了“八雲”之名。
機體特性：各方面都一般，沒有優點也沒什麼缺點，屬於標準型泛用自機
流派：八雲境界拳
彈幕：方符「奇門遁甲」
拳法：
八雲百裂拳、八雲十字斬、八雲鬥勁呼法、八雲飛衛拳（北斗一·情）、境界滅殺（擊破對手的境界，破壞對手）
博麗有情猛翔破、夢想天生（無想轉生變體，可以突破事物界限進行防禦和攻擊）
雷伊早苗南斗義星，遵照諏訪子大人的指示從66隔離區到世界各地尋找神奈子大人，但是一直沒有音訊。結識橙後，一起做了許多大義之事，最終成為了另一名救世主，她將新的希望繫於星蓮船上，對未來抱有樂觀的態度。
機體特性：運動性優異，速度快，但是也只能與聖帝持平，自機，其他方面毫無建樹
流派：守矢風神拳
彈幕：秘術「一子單傳之彈幕」
拳法：
風神蛙破蛇、風神流舞、風神飛翔
博麗夢想幻顏拳、風神無相斷迅拳（高判定，但傷害還是很低）
南斗殉星，廢土幻想鄉頂級大盜，手下的竊賊數不勝數，然而她卻只盜取各種名貴藥材和醫書，為了治好愛麗絲的輻射病四處奔走，雖然個性風流，但實際上並不是壞人。雖然如此，對於後宮的態度還是多多益善的，也曾邀請過橙，但被拒絕了。
機體特性：攻擊力較強，防禦弱，由於劇情要素，除開路人她是能打的角色里最弱的。
流派：霧雨貫殺拳
彈幕：戀符「Master spark」
拳法：
霧雨獄屠拳（南斗骨頭啃）、霧雨雷震掌（南斗來新鮮）、霧雨千臀龍擊（南斗新鮮奧義/用鋼鐵般的臀部以極高的速度撞擊敵人，輕則骨折，重則當場斃命，但是命中不高）
二姨人稱“二姨”，由於BUG牆角流和秒殺機能的存在，是本作中最強大的角色，不過由於劇情限制，雖然能打但出場機會少。核災難後除了染髮換衣服，也有了醫病的愛好，因為永琳的消失，靈夢成了廢土幻想鄉唯一的醫神，其他腹黑興趣隨著八雲紫的失蹤而漸漸淡去，目前只是習慣性的打擊小五蘿莉的怪人集團。
機體特性：牆角流牆角班牆角老師牆角教官牆角師匠
流派：博麗神拳（博麗幻夢拳）
彈幕：夢符「封魔陣」
拳法：
博麗鬥勁呼法、天翔百裂拳、無想流舞、博麗無相斷迅拳、蜜孔-剎活孔（剛、柔拳轉換）
博麗夢想幻顏拳（二姨有情打臉拳，由於該招數無比飄逸和瀟灑，被稱為BUG，早苗的該技能只保留了動作，傷害全沒了）
夢想天生（終極身法）
聖帝空本作BOSS，南斗極星，由於力量過於強大，必須用右臂的制御棒限制，每卸下一節可以增加三倍的實力，據說是灰色聖誕節的直接原因。幼年時被不明身份的人進行了改造，後來於核冬天中被妹紅撿到收養，之後成為了聖帝。雖然是王者，但是由於師父的去世，變得非常孤獨和哀傷，討厭與任何人交往，對幼稚園的同班同學也視而不見（火焰貓燐、古明地覺等），引起了後者的憤慨，也是鬼軍和聖帝軍勢不兩立的直接原因。認為自己是因為長大了，所以才會被人們討厭，所以很羨慕和嫉妒小孩子，與喜愛小孩子的慧音經常產生矛盾。
機體特性：除了彈幕是S，其他全是A
流派：蓬萊鳳凰拳
彈幕：爆符「Peta Flare」、焰星「十凶星」
拳法：
極星十字拳、蓬萊爆星破（南斗馬春花）、天翔十字鳳
EX關BOSS，鬼軍四將領之一，人稱“拳王”，核冬天后隨著古明地覺來到地面征服天下（此時地靈殿已被聖帝阿空霸占）。個性豪爽，身體比其他女性強壯很多，所以看似有些嚇人，不過實際上是個單純直率，好接觸的人。雖然必須聽從覺大人的命令，但是毫不忌諱任何挑戰，也是競技場的常客，習慣在擊倒對手後灌酒。近年來唯一的遺憾和夢想是能夠戰勝靈夢一次。
機體特性：霸體，防高血厚，正面攻擊無比強大，拳法是S，其他全是A
流派：鬼神奔烈拳
拳法：鬼神剛掌破、大江山嵐-吞龍呼法、無想陰殺、三步必殺-天將奔烈
其他（不能打或者打醬油）人物
古明地覺
鬼軍的領導者，雖然地靈殿被占是事實，但每次被問道卻回答因為想征服世界所以才來地上。非常討厭《塞錢戰士靈夢》這個片子，覺得片中的人物對自己是一種侮辱。過度保護妹妹戀，每次出戰從不帶上她。
伊吹萃香
鬼軍四將領之一，具有巨大化的能力，是鬼軍戰略型兵器，能夠使出眼睛鐳射、火焰飛拳、胸部死光等能力，不過很少出戰，平時於世界各處尋找鬼軍頭等消耗品——美酒。
火焰貓燐
古明地覺的部下，曾經非常喜歡阿空，但是因為被無視，所以一直很沮喪，由於勇儀的坐騎“黑王”是貓型，所以阿燐被懷疑在做一些辛苦的工作。
洩矢諏訪子
一直居住於守矢神社舊址，其他情報不明，黑幕中的黑幕。
八坂神奈子
作為參與過戰前會議的黑幕之一，她的主張與核災難有著根本性聯繫，灰色聖誕節後即下落不明，從目前的情報來看，極有可能在天之方舟——星蓮船上。
河城荷取
幻想鄉水利工程師和發明家，曾經在荷取重工工作過很長一段時間，掌握眾多現代技術，據聞在灰色聖誕節發生前夕被秘密轉移到了星蓮船上。
射命丸文
曾經的新聞記者，現在已經升級為銀河廣播電台台長兼廢土幻想鄉SC流通有限公司經理，儘管有著響亮的稱號，但其手下只有犬走椛一人。之所以成為SC界大亨，源於她從森近霖之助那裡獲得的一個紅黑條紋相機，這相機不僅有一般的拍照功能，還能吸收他人的彈幕，並重新生成符卡本身，這樣一來，只要文四處轉悠一下，便能很輕鬆的獲得大量財富。另外具有稀有飛行能力的她很容易弄到情報，販賣情報也是她的第三職業，銀河廣播台的便是她用了大量財富才建成的，不幸的是，因為這件事她和霖之助的關係不如從前了，兩人合體變身的日子一去不復返，只有主持節目的時候，才稍微說會兒話。
藤原妹紅
蓬萊鳳凰拳宗師，由於有不死的身體，所以在灰色聖誕節中沒有受到多少傷。阿空是她四處尋找食物時偶然碰到的，由於慧音躲入了境界之中，所以她不知道要等多少年才能重逢，之前便和這孩子作伴。然而，養育小孩子比想像中要難得多，除了滿足生活必須品外，更重要的是教育。完全沒有經驗的妹紅只能讓阿空學習拳法，來分散她注意力，不過漸漸的，這一招也不大頂用了，因為阿空的力量實在太強了。十字陵一役後，她與慧音，阿空又回復了平和的生活。
上白澤慧音
南斗仁星，曾因為救橙而雙目失明，其武功絕學也漸漸隕落了。然而殘存的戰鬥力卻足以對付一般的雜兵，而她本人也特別喜歡小孩子，便成為了人類之村的老師兼保鏢，這一狀況直到聖帝軍興盛起來才結束，慧音一人終究也無力改變混沌的歷史潮流。
蓬萊山輝夜、八意永琳
灰色聖誕節後行蹤不明，可能在星蓮船上。
森近霖之助
南斗妖星，因為審美能力有限，經常穿過於花哨的衣服而相當顯眼。本作中道具屋、存檔點、情報站、宿屋等NPC功能均由他負責。曾經和風神少女射命丸文是搭檔，一起用隨身碟合體變身成正義使者，但是後來由於耗費巨資建成的銀河廣播台不能讓他主持，相機錢也沒付而對文耿耿於懷，目前與文唯一的接觸是一同作為Queen’s Boxing比武大會的司儀。自稱有寶具霧雨之劍，但從沒見他拿出過。
十六夜咲夜
原紅魔館女僕，灰色聖誕節後獲得“替身”的能力，目前在聖帝的競技場打工。
紅美鈴
原紅魔館守門人，灰色聖誕節後覺醒了里人格“黑魅鈴”，目前在核彈鎮武館當教官。
四季映姬
偶爾來廢土，作為Queen’s Boxing裁判，但總是只會判定黑與白。
小野冢小町
由於廢土幻想鄉死人過多，她一直忙到了現在…
蕾米莉婭·斯卡雷特、芙蘭朵露·斯卡雷特
特邀Queen’s Boxing裁判。由於Queen’s Boxing的規定是由分數來判定勝負，即便打倒了對手也不一定能贏，所以裁判顯得極其重要。
鈴仙·優曇華院、因幡帝
與斯卡雷特姐妹一同作為Queen’s Boxing裁判，也是吃皇糧的。
八雲紫
灰色聖誕節後行蹤不明，但境界還存在的事實說明——她還活著。據說在戰前曾經與神奈子發生過很激烈的衝突，可能與核災難有重要的關係。
八雲藍
灰色聖誕節後將自己改造成了機器狐狸，為的就是穿越污染區找到紫大人。可惜總算有機會離開52隔離區，她依舊沒有找到紫，倒是新的身體還算能打。
帕秋莉
灰色聖誕節後行蹤不明，有人說曾看見她在與愛麗絲打架，可能目前還住在魔理沙那裡吧。
愛麗絲
魔理沙所庇護的少女，似乎得了輻射病，目前在家靜養，其他情報不明。
風見幽香
52隔離區的領主，強制所有人不能離開結界，要為她的花田勞作，目前還住在隔離區。
米斯蒂婭·蘿蕾拉（小碎骨）
有人稱曾在沙漠中撿到她的羽毛，在這食物珍貴的時代，這孩子估計已經…
莉格爾·奈特巴格
風見幽香的S對象，本人不承認喜歡被欺負，唯一有過的叛逆行為是幫助橙逃離52隔離區。
雷蒂
妹紅說核冬天裡有見過她，現在去哪了不知道。
琪露諾
偶爾見她被打出競技場。最近轉職成劍士，帶著西瓜刀於世界各地做任務。
騷靈三姐妹
目前在核彈鎮廣場吹拉彈唱賣藝，不過收入甚微。
魂魄妖夢
偶爾見她來燈火小鎮購買食物，不過可能由於最近的壓力很大，所以見誰都很兇
