1964年,杜祥楚大學畢業後加入中國人民解放軍,在邊疆戈壁軍事基地從事國防科研計算機套用工作。他擔任了多種型號飛彈飛行試驗及定型,以及多種實時控制系統軟體及模擬仿真軟體的總體設計和編程工作;參加了“兩彈一星”的實驗數據的處理和承擔了“兩彈結合”的飛行測量和數據處理任務。1977年,他獲得基地首次科技大會的嘉獎,榮立三等功。1978年,他成功設計光遙測自動化系統,再次榮立三等功。同年,杜祥楚加入了中國共產黨。1979年―1982年,杜祥楚到瑞士學習工作三年,完成了基地新型測量系統的引進工作,獲得國外實時控制軟體系統畢業證書。他回國後,將實踐經驗與軍隊實際套用相結合,完成了引進系統與原有系統的正確對接和全系統的正常運行任務,又一次榮立三等功。
1985年,杜祥楚調入中國人民解放軍空軍指揮學院擔任教學與科研工作。他將基礎理論與高科技相結合,根據航空兵戰術教學的需要,開設新課程,設立新的研究生專業方向“航空兵戰術模擬”和“航空武器作戰使用”。1987年,他被評為教授級高級工程師。1988年,他開發的“HKB軍用圖形軟體包”,榮獲北京地區、軍隊院校協作中心微機開發套用優秀成果獎。1989年,杜祥楚被授予大校軍銜。1990年,他開發的《DSC―1多功能數據採集專用機》,榮獲空軍指揮學院優秀科研成果獎。1992年,他開發的“PL―8格鬥飛彈戰鬥使用分析研究”,榮獲全軍科技進步二等獎,並被評為學院優秀共產黨員。1994年,杜祥楚被調為副軍級,並被中國科學技術協會聘任為全國計算機專家。1995年,他開發的“塔台基礎數據管理系統”榮獲全軍科技進步三等獎和空軍指揮學院二等獎;開發的“塔台指揮自動化系統中定位、標圖的設計與實施方案”,榮獲空軍軍事學術研究成果三等獎。1999年,他開發的“軍民合用機場信息管理系統”,榮獲全軍科技進步三等獎和空軍指揮學院一等獎;開發的“航空武器裝備研製、使用系統的理論及套用”,榮獲空軍軍事理論研究成果三等獎。
杜祥楚在空軍指揮學院工作期間,還擔任了一些院外學術科研工作。他曾被國防科工委聘為全國軍用共性軟體立項評審組評審,兩屆空軍科技進步成果獎評審委員;被航天部聘為研究生論文評審人和哈工大博士生論文評審人;被聘為空軍後勤部《指揮自動化系統》專家組組長;並多次參加了軍內各大部及研究所有關計算機系統項目的評審和技術鑑定。
2001年,經組織批准,杜祥楚退休,享受副軍級待遇。他退休後,先後被北京市工商局、北京市地方稅務局聘為信息系統建設專家顧問。
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