民國26年（1937）“七七”事變，李少棠率部開赴抗日前線。在熱河、綏遠、張家口、山西等地對日作戰。在山西中條山阻擊戰中，戰鬥十分激烈殘酷，他與所部堅守陣地，幾乎全軍覆沒，也未後退。
民國28年（1939），李少棠任17軍駐西安辦事處處長，和故鄉士紳合力籌建西寨農場，購置荊家莊、柴黃嶺等村土地3頃余，調來一個補充營駐場屯耕，種地植樹。李少棠從山東引進倭巾、紅玉等蘋果樹990株，首次在周至縣栽植蘋果，在農場建園15畝，畝產250餘公斤。李少棠又將從河南抗日戰場收容的60名孤兒組織起來，在農場建立難民國小，由王月英任教。2年後，難民國小，由王月英任教。2年後，難民國小遷往平涼。中華人民共和國成立後，人民政府在西寨農場基礎上，擴建成陝西省果樹研究所。
民國37年（1948）李少棠投資1萬銀元，興辦縣內首座米廠，廠內大房3間，廈房4間，大車3輛，工人10餘名。米廠以火力發電為動力。碾制本縣生產的稻穀，日產2500公斤。銷往西安。同時，興辦青化農職中學，領導太白劇社。
李少棠在抗日戰爭中，從反對共產黨轉變到支持同情中國共產黨，與八路軍郭洪濤部來往密切，贈給八路軍汽車6輛及電台、藥品等物品。民國28年（1939）9月，太原失守，李所在的17軍將西渡黃河休整。李代表高桂滋與駐守宋家川渡口的徐向前將軍商談，經中共中央同意，徐向前將軍當即撥給木船8艘，17軍順利渡河。李少棠任17軍駐西安辦事處處長期間，與趙伯平、趙壽山、杜斌丞、楊明軒等人相處融洽。民國34年（1945）1月經楊明軒介紹，李少棠加入中國民主同盟。次年國共合作破裂後，李少棠仍和地下黨聯繫，營救被捕的共產黨幹部和愛國人士，給地下黨提供情況和藥品等。1949年5月，關中戰役展開，李少棠派文書從西安趕到周至，攜帶其秘密信件給秦嶺守備區補充三團團長，講明形勢，申明大義，勸其起義。西安解放後，李少棠被聘為西北軍政委員會參事，與楊明軒等一起策動駐灃峪、太乙宮、周至等地的國民黨地方武裝起義，為西安、周至的和平解放，做出了貢獻。
中華人民共和國成立後，李少棠當選為陝西省一、二、三屆人大代表。歷任周至縣副縣長、縣政協副主席。在反革命分子殺傷鄉長而暴動的永安事件中，李少棠駐澇峪，指揮鎮壓反革命暴亂。1969年1月“文化大革命”中，李少棠被“造反派”揪至子長縣批鬥致死。1979年平反，次年1月在周至舉行追悼大會，習仲勛、汪鋒等中央領導送來花圈。墓在青化鄉嘉會堡外。
