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公元371年三月，前秦西縣侯苻雅、楊安、王統、徐成以及羽林左監朱肜、揚武將軍姚萇率領步、騎兵七萬人討伐仇池公楊纂。
公元373年，朱肜遂拔漢中。徐成攻劍閣，克之。楊安進攻梓潼，梓潼太守周虓守涪城，遣步騎數千送母、妻自漢水趣江陵，朱肜邀而獲之，遂降於楊安。
公元374年十二月，有人入秦明光殿大呼曰：“甲申、乙酉，魚羊食人，悲哉無復遺！”秦王堅命執之，不獲。秘書監朱肜、秘書侍郎略陽趙整固請誅鮮卑，堅不聽。
公元376年，秦王堅以幽州刺史行唐公洛為北討大都督，帥幽、冀兵十萬擊代。使并州刺史俱難、鎮軍將軍鄧羌、尚書趙遷、李柔、前將軍朱肜、前禁將軍張蚝、右禁將軍郭慶帥步騎二十萬，東出和龍，西出上郡，皆與洛會，以衛辰為鄉導。
公元378年九月，秦王堅與群臣飲酒，以秘書監朱肜為正，人以極醉為限。
公元380年二月，前秦在渭城建造了教武堂，命令太學生中明悉陰陽兵法的人教授眾將領，秘書監朱肜勸諫苻堅說：“陛下東征西伐，所向無敵，四海之地，十得其八，雖然長江以南尚未征服，但不足掛齒。這時應該逐漸偃息戰事，增加修行文德。然而剛剛開始建立學宮，就教人征戰之術，這大概不是招致天下昇平的辦法。況且眾將領都是身經百戰，為什麼還擔心他們不熟悉軍事，反而讓他們受教於書生，這不是用來提高他們志氣的辦法。此事沒有實際的好處，又損害了聲名，願陛下考慮！”於是苻堅停止了這種做法。
公元382年十月，苻堅大會群臣於太極殿，對群臣道：“我繼承王業已有三十年，如今北方統一，只有東南一隅不屬秦地。如今大略計算，秦有士卒九十七萬，我將親自伐晉，不知群臣以為如何？”秘書監朱肜認為伐晉必勝無疑。
