概述
中國有機產品認證屬於產品認證的範疇，根據《中華人民共和國認證認可條例》、《有機產品認證管理辦法》（國家質量監督檢驗檢疫總局2004年第67號令）和中國合格評定國家認可委員會相關認可準則CNAS—CC23：2006《〈產品認證機構通用要求〉有機產品認證的套用指南》的要求以及國際通行做法，有機認證程式一般都包括認證申請和受理（包括契約評審）、檔案審核、現場檢查（包括必要的採樣分析）、編寫檢查報告、認證決定、證書發放和證後監督等主要流程。
申請者書面提出申請認證時，根據《有機產品認證實施規則》的規定，應向有機認證機構提交下列材料：① 申請者的合法經營資質檔案，如營業執照、土地使用證、租賃契約等；② 申請者及有機生產、加工的基本情況，如申請者名稱、地址和聯繫方式，生產、加工規模，包括品種、面積、產量、加工量等描述；③ 產地（基地）區域範圍，包括地理位置圖、地塊分布圖、地塊圖；④ 申請認證的有機產品生產、加工、銷售計畫；⑤ 產地（基地）、加工場所有關環境質量的證明材料；⑥ 有關專業技術和管理人員的資質證明材料；⑦ 保證執行有機產品標準的聲明；⑧ 有機生產、加工的質量管理體系檔案；⑨ 其他相關材料。
按照國家質檢總局《有機產品認證管理辦法》、國家認監委《有機產品認證實施規則》等法律法規和GB/T19630《有機產品國家標準》，企業要想將自己的產品作為有機產品銷售，必須通過有機認證。從事有機產品認證的機構必須獲得中國國家認證認可監督管理委員會（簡稱國家認監委，英文縮寫CNCA）的批准。國家認監委（CNCA）網站上對獲批的認證機構給予公布。只有獲得CNCA批准並與公布的認證機構才是合法的可從事認證活動的機構。可以在CNCA網站查詢其批准的認證機構目錄，具體辦法為CNCA網站——綜合服務專區——機構查詢——認證機構名錄——選擇有機產品（共分植物、畜禽、水產和加工四類）。
公眾還可以通過在CNCA網站的“食品農產品查詢”服務區查詢全國食品農產品認證企業名錄及其認證產品等信息。
按照農業部綠色食品、無公害農產品、有機食品認證工作“三位一體、整體推進”的戰略部署，有機食品認證程式及有機食品標誌已正式啟用。
有機食品認證程式
1、申請
申請者向中心（分中心）提出正式申請，填寫申請表和交納申請費。申請者填寫有機食品認證申請書，領取檢查契約、有機食品認證調查表、有機食品認證的基本要求、有機認證書面資料清單、申請者承諾書等檔案。申請者按《有機食品認證技術準則》要求建立：質量管理體系；生產過程控制體系；追蹤體系。
2、認證中心核定費用預算並制定初步的檢查計畫
認證中心根據申請者提供的項目情況，估算檢查時間，一般需要2次檢查：生產過程一次、加工一次，並據此估算認證費用和制定初步檢查計畫。
3、簽訂認證檢查契約
l 申請者與認證中心簽訂認證檢查契約，一式三份；
l 交納估算認證費用的50%；
l 填寫有關情況調查表並準備相關材料；
l 指定內部檢查員（生產、加工各至少1人）；
l 所有材料均使用檔案、電子文檔各一份，寄或E-mail給分中心。
4、初審
l 分中心對申請者材料進行初審；
l 對申請者進行綜合審查；
l 分中心將初審意見反饋認證中心；
l 分中心將申請者提交的電子文檔E-mail至認證中心。
5、實地檢查評估
l 認證中心在確認申請者交納頒證所需的各項費用；
l 派出經認證中心認可的檢查員；
l 檢查員從分中心取得申請者相關資料，依據《有機食品認證技術準則》，對申請者的質量管理體系、生產過程控制體系、追蹤體系以及產地、生產、加工、倉儲、運輸、貿易等進行實地檢查評估，必要時需對土壤、產品取樣檢測。
6、編寫檢查報告
l 檢查員完成檢查後，按認證中心要求編寫檢查報告；
l 該報告在檢查完成2周內將文檔、電子文本交認證中心；
l 分中心將申請者文本資料交認證中心。
7、綜合審查評估意見
認證中心根據申請者提供的調查表、相關材料和檢查員的檢查報告進行綜合審查評估，編制頒證評估表，提出評估意見提交頒證委員會審議。
8、頒證委員會決議
頒證委員會定期召開頒證委員會工作會議，對申請者的基本情況調查表、檢查員的檢查報告和認證中心的評估意見等材料進行全面審查，作出是否頒發有機證書的決定。
9、頒發證書
根據頒證委員會決議，向符合條件的申請者頒發證書。申請者交納認證費剩餘部分，認證中心向獲證申請者頒發證書；獲有條件頒證申請者要按認證中心提出的意見進行改進做出書面承諾。
10.有機食品標誌的使用
根據證書和《有機食（產）品標誌使用章程》的要求，簽訂《有機食（產）品標誌使用許可契約》，並辦理有機/有機轉換標誌的使用手續。
11．保持認證
| 有機食品認證證書有效期為1年，在新的年度里，COFCC會向獲證企業發出《保持認證通知》。
| 獲證企業在收到《保持認證通知》後，應按照要求提交認證材料、與聯繫人溝通確定實地檢查時間並及時繳納相關費用。
| 保持認證的檔案審核、實地檢查、綜合評審、頒證決定的程式同初次認證。
認證機構
國內有機認證機構
中國質量認證中心（CQC）
方圓標誌認證集團（CQM）
北京中合金諾認證中心（COIC）
上海質量體系審核中心（SAC）
廣東中鑒認證有限責任公司（GZCC）
浙江公信認證有限公司（GAC）
杭州萬泰認證有限公司（WIT）
北京中安質環認證中心（ZAZH）
北京中綠華夏有機食品認證中心（COFCC）
中環聯合（北京）認證中心有限公司（CEC）
北京陸橋質檢認證中心有限公司（BQC）
杭州中農質量認證中心（OTRDC）
北京五洲恆通認證有限公司（CHTC）
遼寧方園有機食品認證有限公司（FOFCC）
遼寧遼環認證中心（LEOFCC）
黑龍江綠環有機食品認證有限公司（HLJOFCC）
北京五嶽華夏管理技術中心（CHC）
大連市環境科學研究院
西北農林科技大學認證中心（YLOFCC）
南京國環有機產品認證中心（OFDC）
新疆生產建設兵團環境保護科學研究所認證中心
國外認證機構
歐盟國際生態認證中心（ECOCERT）
紐西蘭有機協會VERYTRUST有機認證
國際有機作物改良協會（OCIA）
德國天然有機認證BDIH
瑞士生態市場研究所（IMO）
