2007年夏天，他被克羅地亞班霸薩格勒布迪納摩（Dinamo Zagreb）以130萬歐元的價格引進，以替代當時已轉回阿森納的明星前鋒愛德華多·達·席爾瓦（Eduardo da Silva）。在薩格勒布迪納摩的第一個賽季，他交出了一張令人滿意的答卷，出場29場12球11助攻，表現出色，但在得牌方面他卻被出示了8張黃牌。在2008-09賽季，曼祖基奇以28次出場攻入16球的表現摘下克羅地亞聯賽金靴。在那之後，他被德甲的勁旅雲達不萊梅（Werder Bremen）相中，但是不萊梅1200萬歐元的報價被薩格勒布迪納摩拒絕，他們認為他們的金牌射手起碼值1500萬歐元這個價。2009年9月17日，薩格勒布迪納摩在歐聯杯賽場上主場0-2不敵安德萊赫特隊（Anderlecht）的比賽中，曼祖基奇由於被指責表現不佳，領到了一張10萬歐元的罰單。這是俱樂部歷史上第一次對球員進行金錢上的處罰。9月20日，他在聯賽中對陣里耶卡隊（Rijeka）狠狠地出了口惡氣，帶領球隊6-0碾壓了對手一回。在賽後接受採訪時，曼祖基奇拒絕對任何關於他將在吃到這張罰單後離隊的傳聞表態。他表示，效力於薩格勒布迪納摩是他兒時的夢想，他只想竭盡全力帶領球隊打好每一場比賽。
