昭通市地方稅務局為雲南省地方稅務局垂直管理的機構，正處級，組建於1994年8月，市局機關現設12個內設機構（辦公室、政策法規科、計畫財務科、徵收管理和納稅服務科、稅政一科、稅政二科、稅政三科、規費管理科、科技信息科、宣傳教育科、人事科、監察室），1個機關黨委，2個直屬機構（稽查局、直屬徵收分局），1個派出機構（昭陽工業園區分局），下轄11個縣區地方稅務局、69個基層分局（所）。
一、昭通市地方稅務局主要職責
（一）擬訂地方稅收中長期規劃和年度計畫，負責組織地方稅收收入，力爭稅款應收盡收。
（二）參與研究綜合經濟政策，提出完善地方稅收管理的建議。
（三）監督、檢查稅收法律法規規章、政策的貫徹執行，組織實施地方稅務系統稅收業務、徵收管理規章制度；組織實施稅收徵收管理改革。
（四）組織地方稅稅源管理、稅收收入分析預測、納稅評估、反避稅、國際稅收管理、稅務稽查、地方稅發票、票證管理等工作。
（五）負責規定許可權範圍內地方稅收減免及其他地方稅涉稅審批事項。
（六）貫徹執行納稅服務管理制度和規範，保護納稅人合法權益，組織稅收宣傳，提供便捷、優質、高效的納稅服務。
（七）負責組織規定範圍內基金、規費的徵收工作。
（八）負責組織本系統信息化建設、管理工作。
（九）負責管理所轄縣（區）地方稅務局。
（十）承辦雲南省地方稅務局和昭通市人民政府交辦的其他事項。
二、機構設定
（一）內設機構根據上述職責，昭通市地方稅務局機關設12個內設機構（正科級）和機關黨委。
1、辦公室
負責機關文電、會務、機要、檔案、督辦、信訪、保密、保衛、事務管理、後勤服務等工作；負責組織起草、審核重要文稿；負責稅收宣傳、新聞發布及政務信息公開；負責機關財務、國有固定資產管理等工作。
2、政策法規科
擬訂依法行政、依法治稅工作方案並組織實施；負責監督、檢查稅收法律法規、規章及規範性檔案的執行；組織協調涉及多稅種、綜合性稅收政策的事項並負責辦理；負責規範性檔案的合法性審核和備案備查工作，並定期進行清理、評估和反饋；牽頭重大稅收案件審理及規範稅務行政審批工作；承擔行政複議、行政應訴及國家賠償工作。
3、計畫財務科
牽頭編制年度稅收計畫並組織實施；負責稅源調查、稅收收入分析預測、重點稅源監控、企業稅收資料調查；負責稅收會計核算、統計核算和稅費票證的領發、管理等工作；負責除社會保險費外的費票繳銷及與銀行的對賬工作。貫徹實施財務管理、基本建設管理規章制度；負責編制部門預算、決算；負責會計核算、會計基礎規範工作，分析考核徵稅成本；組織實施國庫集中支付工作；負責資產購置、使用、處置、清理等工作；負責本系統內部財務審計。
4、徵收管理和納稅服務科(大企業和國際稅務管理科)
貫徹實施綜合性稅收征管法律法規和辦法；提出完善專業化徵收管理的建議；負責稅收征管數據的管理套用及稅收征管風險管理、綜合性納稅評估；負責征管質量考核和征管狀況監控分析；負責稅務登記、納稅申報、普通發票管理、稅控器具推廣套用等工作；負責個體和集貿市場稅收征管、稅收管理員制度的實施；負責納稅服務工作；指導稅收爭議的調解；負責稅務著裝管理工作；參與註冊稅務師的管理。負責大型企業稅源管理、納稅評估、納稅服務和日常檢查工作；組織實施匯合（合併）納稅企業稅收日常檢查工作；牽頭組織國際稅收管理工作。
5、稅政一科
負責營業稅、資源稅、文化事業建設費的稅收業務管理；對有關稅（費）種的具體業務問題進行解釋和處理；負責相關稅源監控管理及稅收收入分析。
6、稅政二科
負責地方稅務系統征管範圍內的企業所得稅、個人所得稅的稅收業務管理；對有關稅種的具體業務問題進行解釋和處理；負責重點企業的稅源管理、稅基管理、涉稅事項審批、彙算清繳；負責相關稅收收入分析。
7、稅政三科
負責城鎮土地使用稅、房產稅、車船稅、印花稅、筵席稅、土地增值稅、城市維護建設稅、固定資產投資方向調節稅、教育費附加、地方教育附加、菸葉稅、契稅和耕地占用稅的稅收業務管理；對有關稅（費）種的具體業務問題進行解釋和處理；負責相關稅源監控管理及稅收收入分析。
8、規費管理科
負責社會保險費及規定範圍內的其他規費的徵收管理；負責社會保險費對賬和報表的統計、編制、上報；負責各項規費政策的貫徹落實；負責組織規費綜合性政策調研，參與起草有關規費政策、規章、法律文書和報告；負責對有關費種的具體業務進行指導、解釋和處理。
9、科技信息科
貫徹實施信息化建設和管理規章制度、信息化建設規劃、實施方案；負責軟體推廣套用和技術培訓；負責信息化建設所需設備配置；負責稅費徵收數據的採集、分析和監控；負責信息系統運行維護和安全管理。
10、宣傳教育科
負責本系統思想政治建設、精神文明建設、文化建設和基層建設工作；擬訂並組織實施教育培訓工作規劃、年度計畫；負責教育培訓項目的開發及管理；組織實施人員培訓、學歷教育管理規章制度；負責培訓質量考核與評估；負責教育培訓經費的預算及管理。
11、人事科
負責本系統的機構編制、人事管理和隊伍建設工作；承擔管理許可權內的幹部任免、考核和領導班子管理工作；參與制定幹部教育培訓規劃；辦理出國（境）人員的有關事務；負責機關和直屬單位離退休人員工作，指導本系統的離退休人員工作。
12、監察室
負責行政監察工作；負責監督檢查有關法律、法規、規章和制度、規定的貫徹執行；按照規定許可權查處違紀案件；承擔行風建設工作。
機關黨委
負責機關和直屬單位的黨群工作。
昭通市地方稅務局設2個直屬機構。
1、昭通市地方稅務局稽查局，正科級。依法承擔查處偷稅、逃避追繳欠稅、騙稅、抗稅案件的工作。設綜合科、一科、二科、三科、四科5個內設機構（不定機構規格）
2、昭通市地方稅務局直屬徵收分局，正科級。依法承擔規定範圍內的稅收徵收管理工作。設綜合科、一科、二科、三科4個內設機構（不定機構規格）。
昭通市地方稅務局昭陽工業園區分局，為昭通市地方稅務局派出機構，正科級。依法承擔規定範圍內的稅收徵收管理工作。
