發展
他成立在1988年，由三個當時已有的研究機構－東京大學的東京觀測所、水澤緯度觀測所和名古屋大學的大氣研究所的一部分－組成。
當2004年，日本全國的研究機構組織再度改革時，NAOJ成為國家自然科學院的分支機構。
機構
三鷹園區（東京，三鷹）
總部，天文資料中心，先近技術中心，公共關係中心
太陽閃焰望遠鏡、太陽黑子望遠鏡、TAMA300重力波檢測
過去的儀器：太陽塔望遠鏡、60公分折射圓頂、20公分折射圓頂
野邊山電波觀測所和野邊山太陽電波觀測所（Minamimaki，Nagano）
45米毫米波望遠鏡、野邊山毫米波陣列、野邊山電波太陽照相機
水澤VERA 觀測所（Ōshū，Iwate）
20米電波望遠鏡、10米VLBI電波望遠鏡
過去的建築物：Dr. Kimura Museum
Norikura Solar Observatory (Norikura山，Nagano)
10公分日冕儀、25公分日冕儀
Okayama Astrophysical Observatory (Mt. Chikurinji, Okayama)
188公分望遠鏡、91公分望遠鏡、65公分庫德式太陽望遠鏡
VERA 20米電波望遠鏡(Mizusawa, Ogasawara, Iriki, and Ishigakijima)
夏威夷天文台（夏威夷大島）
8米望遠鏡（毛納基山）
希羅基地設施（夏威夷的希羅）
