現代醫學的專業化發展被兩股力量驅動。一股力量是科學，以還原論為基礎將醫學劃分為不同的部分，形成各種分支和子分支。另一股力量是文化，以工業模式和商業貿易為核心的現代社會習慣於將具有連續性的人類生活分割成許多片段和許多獨立的問題，每個問題交由不同的專業部門或專家去處理。人們以為，這樣可以顯著提高問題處理效率。而事實上，很多時候結果並非如此，至少在處理人體的問題上，現代醫學這種以分為主的發展方式遇到了瓶頸。現代醫學發展和臨床實踐遇到的最大難題在於專業過度細化（Over specialization）、專科過度細劃（Over division）和醫學知識碎片化（Fragmented knowledge），稱之為2O1F或OF。
2009年11月，由國內21所醫科大學和《醫學與哲學》雜誌社發起、6個全國性學會主辦的“醫學發展高峰論壇”達成了以“醫學整合”為主題的北京共識。2012年，時任中國工程院副院長、第四軍醫大學校長的樊代明院士率先提出“整體整合醫學”（holistic integrative medicine，HIM），簡稱整合醫學的概念。樊院士相繼發表的《整合醫學初探》 、《整合醫學再探》 、《整合醫學縱論》 、《Holistic Integrative Medicine》 、《整合醫學——醫學發展新時代》 、《HIM，醫學發展的必然方向》 、《Holistic Integrative Medicine：Toward a New Era of Medical Advancement》 、《HIM，醫學發展新時代的必由之路》 等文章，全面系統地闡述了整合醫學的理論與實踐等若干問題，引起國內外的強烈關注和反響。中華醫學雜誌、中華內科雜誌、中華消化雜誌、中華肝臟病雜誌、中華內分泌代謝雜誌、中華燒傷雜誌等先後刊登專稿或開闢專欄介紹整合醫學。《整合醫學——理論與實踐》第一卷 和第二卷 由世界圖書出版公司分別於2016年10月和2017年4月正式出版發行。截至目前，全國已成立了6個整合醫學的全國性學術組織，7所大學成立整合醫學或藥學研究院。2017年，“中國整合醫學院聯盟”、“中國整合藥學聯盟”、“中國醫養整合聯盟”、“中國醫體整合聯盟”相繼宣告成立。2016和2017中國整合醫學大會的召開，使得整合醫學的理念深入人心，並由理論向實踐大步推進。
整合醫學和其他醫學模式有什麼聯繫和區別？形象一點說，轉化醫學是路徑；循證醫學是路沿；精準醫學是路標。他們都很重要，但光有路徑、路沿、路標到不了目的地。因為還要有方向盤、車輪、發動機、油箱，要有一台完整的車，特別重要的是還要有一位優秀的駕駛員，才能到達目的地，這就是整體整合醫學。
中國整合醫學大會始於2016年。歷屆中國整合醫學大會：
2016中國整合醫學大會，於2016年10月8日在西安舉行，大會主題是“貴在整合、難在整合、贏在整合”。邀請15名院士、3位著名專家就醫學未來發展方向與前沿技術、整合醫學臨床路徑開發等重大理論與實踐問題進行大會專題報告。4000名代表參加會議。本次大會設立15個分論壇與相關專業委員會籌備大會。重點探討整合醫學相關臨床專科路徑與適宜技術套用。
2017中國整合醫學大會，於2017年4月29日在西安舉行，大會主題是“未來醫學、贏在整合”。52名院士、150餘名醫學高校校長、1000餘名各級醫院院長、14000名代表參加會議。會議開設45個分論壇，國內知名專家學者對醫學未來發展方向和前沿技術、整合醫學相關臨床專科發展與適宜技術等重大理論與實踐問題進行專題研討。大會期間還成立了3個全國性分會、29個專業委員會、啟動16個專業委員會與12個省組分會籌備工作。
2018中國整合醫學大會，將於2018年4月29日在西安舉行，本次大會的主題是“貴在整合、難在整合、贏在整合”。屆時將邀請醫學諾貝爾獎獲得者、國內外知名院士及學者作大會主旨報告，同時舉辦10個專題分論壇以及35個專科分論壇，就整合醫學的發展方向及實踐、醫學前沿技術的整合和套用、整合醫學在相關臨床專科的發展和實踐等重大理論與實踐問題進行專題報告，預計參會人數將近20000人，其中包括兩院院士60餘名、醫學高校校長150餘名、各級醫院院長3000餘名。會議期間，將成立15個全國性整合醫學專業委員會、啟動23個專業委員會與15個省級分會籌備工作 。
