散在重複序列

散在重複序列是與串聯重複序列的組織形式不同的另一類重複序列，是散在方式分布於基因組內的散在重複序列。這類DNA序列一般都是中度重複序列。根據重複序列的長度可以分為短分散重複序列(short interspersed nuclear elements，或short interspersed repeated sequences，SINEs)，，在人基因組中的重複貝數達10萬以上。重複序列單元長度在1 000 bp以上的稱為長散在重複序列(longinterspersed nuclear elements或long interspered repeated sequences，LINEs)，在人基因組中有上萬份拷貝。人類基因組中所有SINE之間的平均距離約為2．2 kb。在結構基因內部，結構基因之間和基因簇內，以及內含子中都有SINEs，但在結構基因的編碼區內中還沒有發現。

散在重複序列是轉座序列，但基因組中多數的SINE和LINE都存在啟動子區的缺失，使轉座所需的酶無法編碼；或者是一端的反向重複序列缺失，使酶無法識別。