概念
飲食是影響腸道菌群組成的最重要因素，不同的飲食結構，可以形成不同的菌群結構；結構失調的腸道菌群可能是誘發慢性病的重要因素。
中文名稱慢性病的腸源性學說
英文名稱Gut Origin of Chronic Diseases
創始人
上海交通大學生命科學技術學院副院長趙立平教授。該文發表在《Journal of Biotechnology》2010年9月1日第3卷第149期。
內容
諾貝爾獎得主里德伯格（Lederberg）提出“人是與共生微生物構成的超級生物(superorganism)”，人基因組和微生物組共同作用影響人體的免疫、營養和代謝過程。
從細胞的角度看，人體不僅僅是一個人的細胞構成的軀體，它是一個由人的細胞和共生微生物細胞共同構成的複雜系統。從基因的角度看，人體內有兩個“基因組”：一個是從父母那裡遺傳來的人基因組，編碼大約25,000個基因，叫做“第一基因組”；另一個則是人體內多達1000多種共生微生物的遺傳信息的總和，叫“微生物組”，也可稱為“元基因組”，它們所編碼的基因有100萬以上。第二基因組的基因容量是第一基因組的至少100倍，可見其對人體健康的作用和影響是不可忽視的。
在人體中，人的細胞數量僅占細胞總量的10%，而共生微生物的細胞所占比例高達90%。共生細菌大部分生活在腸道里，有大約1.5千克。這些細菌在生長活動中產生的代謝物可以進入人的血液，影響人的健康。有益菌可以產生消炎、鎮痛、抗氧化的物質，還可以合成維生素、胺基酸、丁酸鹽等營養成份，對人體有滋養和保護作用。有害菌則可以產生神經毒素、致癌物質和游離抗原，進入血液後能夠引起兒童自閉症、老年痴呆、肥胖症、糖尿病、冠心病、甚至癌症等各種慢性病。腸道菌群具有至少1000多種細菌，攜帶著大量的基因。這就意味著，人體內其實有兩個基因組在影響人的健康，一個是先天遺傳來的人的基因組，帶有約2萬多個基因，另一個是後天進入人體但終身與人相伴的所有共生微生物構成的“微生物組”，帶有至少上百萬個基因，相當於人的第二個基因組。
結構失調的腸道菌群可能是誘發慢性病的重要因素，這個觀點叫“慢性病的腸源性學說”，該學說由趙立平教授在2010年正式提出。趙教授研究組的工作表明，飲食是影響腸道菌群組成的最重要因素，不同的飲食結構，可以形成不同的菌群結構。長期食用高脂肪、低纖維的食物，可以造成腸道菌群結構失調，增加進入血液的毒素的量，誘發慢性炎症，從而導致肥胖、糖尿病、冠心病等慢性病的發生。慢性病的腸源性學說以《Whole-body systems approaches for gut microbiota-targeted,preventive healthcare》為名發表在Journal of Biotechnology和《國際微生物生態學會會刊》(The ISME Journal)上。
