歷史淵源
淨峰寺（861年），該寺在宋、元、明、清都有重修，光緒二十八年寺被一把大火燒毀，1902年鄰近村落倡議大修，得到清代舉人許宗澄、張春其、許少熙、王莊、劉文元等名人的回響和支持，於1904年動工 修復該寺舊有建築。“文革”期間被毀，1982年各方熱心人士組織淨峰寺文物古蹟修復保護董事會，凡舊有寺宇、庭台、迴廊、花園、山亭、登山古道均由民眾及僑胞捐資修葺一新，後又捐建山門、停車場等建築，使整座寺宇既存古貌，又展新姿。
淨峰寺的傳說
惠安淨峰山圓豐端秀，山上多如水齧射狀的怪石，石縫中常能揀到貝殼。它的由來一段很有趣的傳說：
傳說以前淨峰山不是座山，而是一片汪洋大海，屬東海龍王的轄區。一天，東海王的軍師牡蠣王要向東海龍王匯報情況，恰巧龍王不在。作為東海龍王的軍師，牡蠣王出入自由，它看見龍王的案頭上有一隻包裝精緻的木棉盒，還發出一道道金光。懷著好奇心，牡蠣王打開盒蓋一看，原來是顆長生不老仙丹，便起了不良之心，將它偷吃了。
東海龍王回來後，不見了仙丹，大發脾氣，命令文武百官查找也沒有結果。這牡蠣王偷吃了長生不老仙丹後，好久稱病在家，不敢見龍王。龍王見自己的軍師病了，且時間不短，先是派蝦將去探病，後來自己親自去。但見牡蠣王面色紅潤，似無病態，只是神態有些可疑。再說牡蠣王見龍王親自來，畢竟做賊心虛，言語支支吾吾，表情也不大自然。
東海龍王回官後，越想越不對勁。細想手下曾說那天牡蠣王有來過。於是便傳令牡蠣王進官議事。牡蠣王硬著頭皮來見龍王。在龍王的嚴厲追問下，牡蠣王不得不招了。龍王見仙丹也回不來了，牡蠣王又有不少功勞，便下令將它鎖在堅固的牡蠣殼內，不準出來。哪知牡蠣王自由慣了，鎖在裡面，憋得難受，趁蝦兵蟹將不注意，連貝殼一起滾進海底，逃離了東海龍宮，然後使出渾身氣力，把身子一步步往上騰，這樣牡蠣王的身子變成一座山峰與陸地相連線，山頭露出水面，成了而今的淨峰山。淨峰山上的岩石縫裡揀到的牡蠣貝殼就是牡蠣王變的。
淨峰寺在民間還有另一個傳說，話說八仙之列的仙人李鐵拐，一腳踩在淨峰山山頂的巨石上，另一隻腳跨到泉州仙公山，從淨峰山橫跨到仙公山，從此淨峰山山頂的一塊巨石上留下李仙公的足跡，現今巨石旁有立碑“仙跡”。介於此，眾多附近百姓和香客也稱淨峰山為“仙公山”。
弘一法師與淨峰寺的傳奇情緣
1935年<民國24年>，歲次乙亥，春末，弘一大師時年56歲。在泉州開元寺講見月律師的《一夢漫言》畢，移居溫陵敬老院，為老人開示日常勞動諸事，並擬往惠安錢山度夏。上人與惠安有殊勝之因緣，在赴惠安淨峰寺安居時，弟子廣洽與傳貫二師隨行。
於淨峰5個多月的日子裡，大師除研習南山三大部與靈芝律師三記外，亦為廣師代擬修持日課，其間曾數次致書方外舊友夏丏尊，盛道淨峰環境之美，民風古樸，猶如世外桃源。因而，在秋晚時節移居草庵前，作下《將離淨峰詠菊志別》一詩（“我到為植種，我行花未開，豈無佳色在，留待後人來 。”），並記下他將離淨峰時的心情：“乙亥首夏來淨峰，植菊盈畦，秋晚將歸，猶含蕾未吐，口占一絕以志別”。 現今在淨峰寺弘一法師故居門旁立有一碑，碑記此詩文字。
文化信息-五律
年始小寒冬，登臨向佛宗。
島環三面水，寺聳一隅峰。
極目沙灣淺，虔懷樹影濃。
浮舟滄海麗，邊際卷蔥蘢。
摯愛古今同，牆沿艷刺桐。
醒園無獨夢，禪室透香融。
塵絕山巒淨，風來燭火熊。
大師曾手植，問菊滿堂紅
