基本資料
長度：24千米
寬度：14千米
耐久度：8000
速度：7（飛行）
主武器：聯裝摺射稜鏡（對地）、飛彈（對空）
輔助設備：逾時空傳送儀、時間機器（只能進行時間靜止）
射程：18
威力：225×2
背景故事
悖論引擎是盟軍悖論計畫中的主要部分，同時也是盟軍對抗厄普西隆的最後底牌。
從本質上講，悖論引擎與其說是一個攻擊武器，不如說它更像是一個門，一個連通悖論空間的門，一個時間裡存在多個不同的空間，悖論引擎就是這樣儲備部隊的。（所以它就是關於逾時空傳送的啟動引擎，這就是為什麼是“悖論引擎”而不是“悖論戰艦”之類的。）由於愛因斯坦教授因逾時空技術導致一系列實驗員的犧牲而銷毀和封存了大量關於逾時空技術的資料，這間接導致了悖論引擎項目的研發時間一再拖後。但是在尤里奪取了逾時空技術後，悖論引擎項目被重啟並在倫敦要塞命運科技機庫緊急組裝。
悖論引擎搭載了不少高精尖設備，這些設備除了成本高以外還有較高的電力消耗。於是盟軍為悖論引擎設計了兩個備用電池，其中一個在阿松森島被厄普西隆的突擊隊摧毀，另一個在特內里費島成功充電並傳送回悖論引擎。
在厄普西隆負責攻擊倫敦要塞的部隊被悖論引擎擊潰後，尤里意識到他手中幾乎所有力量都無法與悖論引擎相抗衡，即使是空中要塞伊利卡拉也不能與之匹敵。或許只有天秤能夠對付悖論引擎，但是天秤因暴走後留下的後遺症而沒有恢復全部力量。
出現場景
1.厄普西隆戰役第十七關“天賜”
在厄普西隆關閉力場護盾後，悖論引擎從命運科技機庫中飛出，瞬間全殲了異教的部隊並擊落了空中要塞伊利卡拉，令尤里十分驚慌。（劇情殺）
從命運科技機庫中飛出的悖論 2.同盟國聯軍戰役第十七關“瓶頸”
悖論引擎在倫敦要塞倖存部隊的護送下行駛到錫利群島，在錫利群島上空發動了時間停止後離開。在這個任務中，悖論引擎首次使用了“時光護盾”。
悖論引擎的時光護盾 3.同盟國聯軍戰役第二十二關“極晝”
藉助悖論引擎的時間停止，歐洲聯盟的先頭部隊清理了海岸的厄普西隆部隊並建立了基地，這之後悖論引擎在雷神炮艇的護送下出現。並再次使用了時間停止，使指揮官成功將厄普西隆的一架空中要塞伊利卡拉一波帶走（這架伊利卡拉是8000的血，對指揮官來說非常棘手）。
任務開頭出現的悖論圖片 4. 厄普西隆戰役第二十二關“晴天霹靂”
盟軍突破厄普西隆南極要塞的第一道防線後，悖論引擎使用逾時空傳送突襲了第二防線前線的基地，異教的基地因為在悖論引擎的影響範圍之外而倖免，但隨後趕到的悖論引擎引發了時空異變摧毀了異教的基地，導致異教的部隊團滅，異教麾下的兩架空中要塞伊利卡拉也在這場時空異變中被摧毀。（如果提前摧毀的話也會導致任務繼續，厄普西隆前線部隊被擊敗）
悖論引發時空異變 