歷史沿革
2006年，《微生物與感染》創刊，為季刊。
2012年，《微生物與感染》編輯部遷至上海市東安路131號4號樓213、215室；同年起，該刊加入中國知網學術期刊優先數字出版系統。
2014年12月，正式成為原國家新聞出版廣電總局第一批認定學術期刊。
2015年，改為雙月刊。
2018年第1期起，開通HTML格式全文閱讀模式。
辦刊條件
欄目方向
《微生物與感染》內容涉及與人類、動物和植物感染相關的微生物，如病毒、細菌、真菌、立克次體、螺旋體、支原體等的生物學及分子生物學特性，抗感染免疫，實驗室診斷技術，臨床感染及流行病學與防疫等方面的研究；設有綜述、編譯、文摘、國際學術交流、臨床微生物學、動態、網上快訊等欄目。
人員編制
截至2018年3月，《微生物與感染》擁有國際編委5人、常務編委32人、編委60人。
| 職務 | 姓名 | ||||
| 國際編委 | Shan Lu | SHI Wenyuan | SUN Ren | TANG Yiwei | Daoguo Zhou |
| 常務編委 | 蔡啟良 | 高謙 | 郭曉奎 | 何禮賢 | 華修國 |
| 黃瑞 | 黃玉仙 | 李曉虹 | 李振軍 | 廖萬清 | |
| 劉佩紅 | 劉偉 | 潘煒華 | 戚中田 | 沈旭 | |
| 宋元林 | 孫建和 | 童文燕 | 汪萱怡 | 王龍妹 | |
| 王明麗 | 肖明 | 謝青 | 姚堃 | 余平 | |
| 袁正宏 | 臧國慶 | 張繼明 | 張曦 | 張欣欣 | |
| 鍾江 | 朱啟鎔 | ||||
| 編委 | 安靜 | 陳永平 | 鄧啟文 | 郭德銀 | 韓儉 |
| 韓俊 | 胡必傑 | 黃彬 | 賈繼輝 | 賈旭 | |
| 江麗芳 | 焦新安 | 賴小敏 | 藍樂夫 | 李朝陽 | |
| 李崇山 | 李華茵 | 李琦涵 | 李用國 | 林旭 | |
| 柳燕 | 陸路 | 繆曉輝 | 潘衛 | 彭奕冰 | |
| 祁芝珍 | 錢淵 | 喬文濤 | 秦金紅 | 沙巍 | |
| 邵一鳴 | 沈銀忠 | 舒躍龍 | 孫文長 | 湯華 | |
| 湯華民 | 唐神結 | 萬朝敏 | 王建 | 王健偉 | |
| 王佑春 | 吳淑燕 | 徐苗 | 徐志凱 | 許潔 | |
| 嚴傑 | 楊雅驪 | 應天雷 | 余方友 | 袁俐 | |
| 袁志明 | 曾玫 | 張芳琳 | 張敬仁 | 趙守松 | |
| 鄭伯建 | 鍾照華 | 朱汝南 | 朱為 | 祝秉東 | |
辦刊成果
出版發行
2012年，《微生物與感染》發表主編寄語1篇、特約專稿8篇、論著15篇、綜述18篇、講座l篇、讀者·作者·編者2篇，共45篇文章，約50萬字。其中各類基金資助課題文章35篇（77．78%），分別為國家自然科學基金的文章16箱，“十一五”或“十二五”國家科技重大專項的文章11篇、國家“863”項目的文章1篇，國外基金項目的文章l篇，省市級基金項目的文章16篇，其他項目資助的文章8篇。
截至2018年1月，《微生物與感染》與新加坡World Scientific Publishing Company （世界科技出版公司）合作的英文書《Recent Works on Microbes and Infections in China--Selected from the Journal of Microbes and Infections》已出版。
據2018年10月28日中國知網顯示，《微生物與感染》共出版文獻1001篇。
據2018年10月28日萬方數據知識服務平台顯示，《微生物與感染》共載文1579篇。
收錄情況
《微生物與感染》被中國科技論文統計源期刊（中國科技核心期刊）、中國期刊全文資料庫、中文科技期刊資料庫、中國知網、萬方資料庫收錄。
影響因子
在中國學術期刊影響因子年報（自然科技與工程技術2012年版）中，《微生物與感染》2011年的影響因子為0.525，總被引頻次為280，略同於2010年的該兩項指數。
據2018年10月28日中國知網顯示，《微生物與感染》總被下載118306次、總被引2799次、（2018版）複合影響因子為0.583、（2018版）綜合影響因子為0.457。
據2018年10月28日萬方數據知識服務平台顯示，《微生物與感染》被引量為2734、下載量為51929；據2015年中國期刊引證報告（擴刊版）來源數據顯示，期刊影響因子為0.594，在全部統計源期刊（6735種）中排第2374名、在基礎醫學（77種）中排第42名。
榮譽表彰
《微生物與感染》曾獲獲衛生部《國外醫學》系列評比三等獎。
2012年1月，《微生物與感染》在“2011年上海市期刊編校質量檢查”中獲“優秀”稱號。
2016年6月，《微生物與感染》獲“第二屆上海市高校優秀科技期刊獎”。
文化傳統
《微生物與感染》旨在建立一個學科間交叉﹑基礎聯繫臨床和公共衛生預防的平台，以利於傳播科研成果，培養學科人才和促進國內外學術交流。
《微生物與感染》以服務讀者和作者為己任，以學術質量第一為原則，注重學術道德，弘揚創新精神，維護學術誠信，抵制學術不端，恪守出版職業道德。
刊名現任領導
| 職務 | 姓名 |
| 名譽主編 | 聞玉梅、翁心華 |
| 主編 | 瞿滌、張文宏 |
| 副主編 | 陳力、盧洪洲、王洪海 |
| 截至2018年3月 | |
