2002年設立的復旦附中國際部（Fudan International School，簡稱FIS）是為了促進中國學生與各國學生們的相互了解與交流，通過對不同民族文化的相互理解、學習與認同，為培養優秀的國際化人才打好高中階段的紮實的學科基礎。
復旦附中與哥倫比亞大學教育學院和國際關係與公共事務學院共同合作，拓展建立復旦附中國際部課程，引入先進的國際學校管理模式，把中美兩國基礎教育嚴謹紮實的傳統和探索批判的精神結合起來。國際部將招收境外學生，實行中英雙語教學，由哥倫比亞大學教育學院組織招聘具有豐富教學經驗的教員任教，同時還將聘請擁有長年美國私立高中管理經驗的校長擔任國際部顧問。
國際部真正結合了東西方高中學校的優點，這優勢將不僅在於指導學生能順利進入復旦、北大這些中國最好的學校或者哥倫比亞、哈佛這樣的著名學校，更在於提供了寬闊的國際交流平台，哥倫比亞大學國際與公共事務學院將幫助國際部的學生參加聯合國、國際衛生組織、國際法庭等國際機構的實踐，同時還將有來自國際貨幣基金組織、世界銀行等機構的校友對學生進行一對一的學習與生活指導。這些活動將有助於我們的學生為今後進入國際主流社會，做好適應未來工作和生活環境的準備。
2009年，學校與清華附中國際部聯手設立1000萬元獎學金計畫同時啟動，優秀學生最多可獲相當於一半學費的獎學金。
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