基礎醫學院下設行政、教學科研、學生工作三個辦公室,按中醫基礎學科和西醫基礎學科類共設12個教研室以及2個直屬實驗中新(包括中醫實驗教學中心、中醫實驗研究中心)。擁有碩士學位授予點4個(中醫基礎理論、中醫臨床基礎、醫史文獻學和中西醫結合基礎);院級重點學科3個(中醫基礎理論、中醫臨床基礎、醫史文獻學);院級重點課程3門(中醫基礎理論、解剖學、微生物與免疫學);省級精品課程一門(中醫基礎理論)。
基礎醫學院在發展歷程中湧現有一批國內、區內名老中醫。如林沛相、班秀文、秦嘉、家泰教授等。擁有教職工、教師200餘人。近年來,又採取外引、內培、以老帶新等方式進一步加強師資隊伍建設,使師資素質不斷提高,結構不斷最佳化。
在教學資源方面,學院擁有基礎醫學實驗室11個(解剖學、組織學與胚胎學、寄生蟲學、生物學、生理學、生物化學、微生物學與免疫學、公共衛生學、中醫保健美容、中醫實驗教學中心、中醫實驗研究中心)。2000年在同類院校中率先建成兩個具有國內先進水平的電腦化生理機能實驗系統實驗室;2001年建成了獨具特色的人體生命科學館和中國醫學史展館。在學院的教學、科研及對外學術交流活動、科普宣傳等方面發揮了重要的作用。2002年加強了生物化學教研室分子生物實驗室的建設,促進了教學、科研工作的引向深入。另學院各教研室擁有專業參考書籍、出版刊物近五千冊,可供網路查閱的各類電子圖書數萬冊。
基礎醫學院作為主要的教學單位,承擔學院各專業層次供38門課程的教學工作。多年來,基礎醫學院注重教學管理和教學研究工作,不斷提高師資隊伍的業務素質,促進教師教學方式和套用新的教學手段,切實提高師資隊伍和教學質量。目前,大部分課程教學已從單一傳統的模式向多媒體教學過度,現在已經完成了多媒體教學的轉化。在中醫教學發展質量上已經得到了提高。
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