2005年1月南洲水廠實現了日供水量100.8萬m3/d ， 2005年5月26日“100萬m3/d水廠自動化綜合監控系統”項目科技成果通過了由廣東省科技廳專家組成的鑑定委員會的鑑定，目前南洲水廠已實現了對水廠整個生產流程的自動監控。
自投產以來，南洲水廠在各級黨政部門的關懷和領導下，努力樹立和落實科學發展觀，開拓創新，與時俱進，成為廣州市市政行業和廣州市自來水公司的對外視窗，兩年來共接待中外各界來賓44批約1300多人次，並於2006年10月榮獲了“廣州市文明單位”的稱號。
南洲水廠作為自來水公司飲用淨水質量管理體系的重要部分，2005年1月順利通過ISO9001：2000認證，為生產安全優質的飲用淨水提供有力保障。南洲水廠的建成開啟了廣州供水現代化的大門，最佳化了廣州市的供水布局，為滿足廣州市用水需求提供了有力的保障。
水處理工藝流程為：取水—>臭氧處理—>格線反應池>—沉澱池—>濾池—>活性炭—>清水池—>提升泵—>配送
