實際作用
以上面提到的東大阿派為例，由於公司市場前景廣闊，具有很高的成長性，受到投資者的追捧，股價上升，市盈率居高不下，但以公司每年80%的利潤增長速度，以現價購入，一年後的市盈率已經大幅下降；相反，一些身處夕陽產業的上市公司，目前市盈率低到20倍左右，但公司經營狀況不佳，利潤呈滑坡趨勢，以現價購入，一年後的市盈率可就奇高無比了。
市盈率高，在一定程度上反映了投資者對公司增長潛力的認同，不僅在中國股市如此，在歐美、香港成熟的股票市場上同樣如此。從這個角度去看，投資者就不難理解為什麼高科技板塊的股票市盈率接近或超過100倍，而機車製造、鋼鐵行業的股票市盈率只有20倍了。當然，這並不是說股票的市盈率越高就越好，我國股市尚處於初級階段，莊家肆意拉抬股價，造成市盈率奇高，市場風險巨大的現象時有發生，投資者應該從公司背景、基本素質等方面多加分析，對市盈率水平進行合理判斷。
判斷方式
目前計算市盈率的過程中，比較通用的方法是先將虧損股剔除，計算所有股票的市盈率，並根據流通市值加權計算平均值。這種算法存在的問題是，有的績差股市盈率較高，依次得出的平均市盈率容易受到影響形成失真。此外，還有將市盈率取倒數並進行平均的算術方法，也不盡科學。對於像我國股市這樣盈利水平增長較快的市場，較為合理的算法應是將全部股票總市值相加，除以全部上市公司的淨利潤，即以總市值比總收益，這樣可以將所有權重計算在內。相對而言，後者有利於投資者對股市形成總體判斷。
另外，由於股市表現和經濟表現都存在波動，且上市公司盈利相對GDP會存在一定的敏感度，因此當經濟實際增長率超過潛在增長率的時候，上市公司盈利水平將可能出現放大效應，大大高於GDP的增速；當實際增長率低於潛在增長率的時候，上市公司盈利的縮減幅度往往也超過巨觀經濟。所以，市盈率指標也很容易因為經濟波動而產生較大波動，以簡單的市盈率指標來進行估值判斷，往往是不夠準確的。
由於結構性問題的存在，投資者在以市盈率水平為依據指導投資行為時，必須對具體股票進行細化研究，認真分析上市公司盈利的來源；同時，也要重視結構性的問題，不能用總體指標來解釋結構性的問題。
