物種學史
巴氏巨齒龍早在1676年，英國牛津市附近一處石灰岩採石場，就發現了一些奇怪的骨頭化石。化石隨後被交給牛津大學的羅伯特·波爾蒂教授，他同時也是阿什莫林藝術與考古博物館的館長。波爾蒂教授對這些奇怪的化石深感興趣，他測量、素描並描述了它們，發表在次年出版的《津郡自然史》（The Natural History of Oxfordshire）一書中。
波爾蒂教授認為這些骨頭中最大的那塊，是一種大型動物的股骨遠端，而且，這種大型動物實在太過於巨大，在現生所有動物中都沒有記錄，也就是說，它並不屬於任何已知的物種。遺憾的是，這批化石後來莫名其妙地失蹤了。
在那個獵奇或迷戀於自然物件的年代，波爾蒂教授留下的股骨素描被一位叫理察·布魯克斯的學者撿了起來重新研究。1763年，布魯克斯將骨頭命名為巨人陰囊（ Scrotum humanum），因為它們是如此對稱！好在，沒什麼人搭理他。
巴氏巨齒龍1815年，英國的礦工們在斯通菲爾德採石場發現了許多化石。化石隨後被徵集到牛津大學，落到威廉·巴克蘭教授手中。
巴克蘭教授對化石還是頗有心得的，他仔細觀察了這些標本，暗忖他們並不屬於已知的動物。過了幾年，拿破崙戰爭結束後，法國比較解剖學家居維葉拜訪了巴克蘭，他認為這些化石可能屬於一種巨大、類似蜥蜴的動物。
1824年，巴克蘭與詹姆士·帕金森在《地質學會彙刊》（Transactions of the Geological Society）上發表文章，將這些化石的主人命名為巨齒龍（ Megalosaurus），他描述的化石包括一個不完整的下頜與牙齒、一些脊椎骨、以及部分腰帶、肩帶和後肢，雖然這些化石很可能來自於不同的個體，但它們的相對尺寸相似，解剖特徵都表明它屬於爬行類。巨齒龍因此成為最早科學命名的恐龍。不過，巴克蘭的命名並沒有遵照林奈的雙名法，只是給出了 Megalosaurus這個屬名，而無種名。1827年，命名禽龍的偉大地質學家，吉迪恩·曼特爾將巨齒龍列於他的英國東南部的地質概況中，並賦予巨齒龍一個種名，將其贈予巴克蘭：巴氏巨齒龍（ M. bucklandii）。又過了許多年，1842年，理查·歐文終於建立了恐龍這個分類單元。
如果嚴格地根據國際動物命名委員會的規定，它要比後來才命名的巨齒龍更具有優先權。也確實有學者曾跳出來，要求遵照老祖宗的法制，把巨齒龍更名為“巨人陰囊龍”。所幸，聰明的老祖宗留了一後招，如果一個分類學名詞在發表後50年內都未曾被引用，該名詞將不再擁有優先權。
形態特徵
因為是第一隻命名的恐龍，巨齒龍的復原歷史也很有意思。
早期的地質學者、古生物學者對恐龍的概念無異於盲人摸象，基本都是以現生蜥蜴、犀牛、大象以及清奇的腦洞做為參考，水晶宮公園中的巨齒龍雕塑便擁有犀牛般巨大頭部，以四足行走，活脫脫的一個怪物版本。
直到19世紀中期，北美洲發現了更加完整的獸腳類，學者才能更準確地描繪出巨齒龍的姿態——它以後足行走，長長的尾巴平衡前端身體的重量，捕獵主要靠一口大牙，前肢可以起到輔助作用。
不過，即便直到今日，巨齒龍依然沒有發現完整的骨骼。根據化石推斷，巨齒龍長約9至10米，體重約1噸，歸在恐龍中的獸腳類。從頜骨看，巨齒龍擁有相當大的頭部，牙齒碩大且鋒利，這或許是中文名巨齒龍的由來。和大多數大型的獸腳類恐龍一樣，巨齒龍可能是獨行俠，靠伏擊、獵殺侏羅紀中期的劍龍類或蜥腳類為食。
