學院設有辦公室、教務科、學生科3個行政科室，藥理學教研室、藥劑學與藥物分析教研室、藥物化學與天然藥物教研室、臨床藥學教研室4個教研室，以及一個教學實驗平台——藥學實驗中心，並依託藥物研究所為主要科研實驗平台。其中藥學實驗中心面積約400平米，藥物研究所面積約700平米，設備總值1200多萬元（其中藥學實驗中心600多萬元，藥物研究所600多萬元)。擁有液質聯用儀、液相色譜儀、氣相色譜儀、紅外光譜儀、紫外分光光度計、凝膠電泳成像系統等精密儀器設備。承擔國家科技支撐計畫2項、廳局級課題15項，發表文章88篇（其中SCI 9篇）。
藥學院具有一支朝氣蓬勃、銳意進取、學歷專業結構層次比較合理的師資隊伍。現有專業教師43人（校本部專任教師及實驗人員29人），其中教授（或相當職稱）5人，副教授（或相當職稱）10人。教師擁有博士學位7人（其中博士後2人），在讀博士4人，碩士學位29人。留學歸國人員4人，四川省衛生和計畫生育委員會學術技術帶頭人及後備人選各1人，四川省中醫藥管理局學術和技術帶頭人1人。
藥學院現有在校碩士研究生18人，主要研究方向包括：心血管藥理學、分子藥理學、藥物代謝組學、循證藥學、藥物新劑型及藥代動力學等。
