科室設定岑溪市中醫醫院開設有內科、外科、婦科、兒科、骨科、肛腸科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、皮膚科、急診科和針灸推拿痛症康復科等12個臨床一級科室以及中風科、泌尿科、肛腸科、肝膽科、燒傷科、脊柱科等二級專業科室和13個專科門診。