有與職業病相關的學科：泌尿科、血液科、腦血管科、以及骨科、普外科和婦產科。門診科室的設定，從服務和專科建設兩個層面出發，設有門診內科、外科、婦科、皮膚變態反應科、口腔科、耳鼻喉科與眼科、同時整合中醫針灸、理療、按摩專業組成中醫特色的康復科。醫技科室設有高壓氧科、手術室、麻醉科、藥劑科、營養科、消毒供應室、集中供氧室等。醫院設有各專業委員會11個。均為了保證醫院各項工作和管理的正常運行。
山西省第二人民醫院泌尿科做為山西省第二人民醫院的重點科室，是一個集診斷、治療、預防、科研、教學為一體的科室，全科共有醫護人員19名，其中高級職稱3名、中級職稱9名、初級職稱7名，100%專科以上學歷。科室開展項目有：男、女生殖感染性疾病的診治；男女性傳播疾病的診療；男女不孕症的診治；男性性功能障礙的診治。於2003年六月通過衛生部，衛生廳驗收，被評為“省級青年文明號”稱號。
2005年前性病診療市場存在較多的不規範行為，導致很多患者身心受到嚴重損害，從2005年1月1日起，政府與衛生部門開始整頓醫療市場，實行“準入制”凡未經評審驗收的醫療機構不得從事性病診療工作，同時開展“性病規範化門診”的創建活動，山西省第二人民醫院泌尿科被山西省衛生廳指定為“省級合格性病規範化門診”，開展性病診療。
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根據衛生部“性病治療規範化門診”的要求。科室內設有獨立的化驗室、治療室、藥房、收費室、液療室、健教室，科室內擁有大型CUG-前列腺康復治療系統，治療急、慢性前列腺炎；獨家引進PDT—光動力治療系統，專業治療病毒濕疣、生殖的皰疹，另外還有B超機、微波機、微米機、性功能康復儀、體外短波治療儀等先進診療設備。
科室做為“省級合格性病規範化門診”能開展真菌直檢、真菌培養和藥敏、蠕形蟎檢測、疥蟲檢測以及體外過敏原檢測等項目，為臨床診斷的準確性提供了有力的保障。在對各種病原體培養檢測、藥物敏感實驗基礎上的中西醫結合治療，治療各種性傳播疾病：淋病、梅毒、生殖器皰疹、尖銳濕疣、軟下疳、非淋菌性尿道炎、性病性淋巴肉芽腫等，尤其對頑固性生殖器皰疹、反覆發作性尖銳濕疣、久治不愈的衣原體、支原體引起的生殖泌尿系感染方面的治療有著獨到的技術和經驗，科室實行人性化服務，尊重患者隱私，每一位患者都享有“個性化治療”，被社會讚譽為“高品質專科”;“性病診療、山西第一品牌”等美譽，得到患者很高的評價。
科室除了在性傳播疾病治療上對社會做出很大貢獻外，在前列腺疾病、性功能障礙、男性不育症、生殖整形、精囊疾病、睪丸附睪輸精管疾病等各種疾病治療上，其治療技術與療效亦得到了眾多患者的充分肯定。
