該濕地公園內生物多樣性豐富，生物類群是環膠州灣區域的典型代表。公園處於中國三大候鳥遷徙路線的東線主幹線上，是遷徙候鳥的重要停歇驛站，重點保護與珍稀水禽眾多，有金雕、白肩雕、白尾海雕等8種一級重點保護動物，有黃嘴白鷺等16種二級重點保護動物；有狐、黃鼬等29種山東省重點保護動物；還有雀鷹等20種動物列入《瀕危動植物種國際貿易公約》。
此外，濕地公園歷史文化與民俗文化底蘊深厚，有中國唯一的海上運河——馬濠運河、獨特的生態民居——海草房、悠久的琅琊文化，以及燦爛的海洋科技與軍港文化。
唐島灣濕地公園劃分為保護保育區、恢復重建區、宣教展示區、合理利用區和管理服務區5個功能區。試點期間，各個功能區將進一步實施生態保護建設系統工程。
保護保育區
以唐島灣水域及灘涂為主體，占濕地公園總面積的75.3%，將以保護水質和水禽棲息地為重點，實施水質保護工程、前海灘涂生態系統修復工程等，維護港灣正常的水體交換功能，構建結構完整、功能完善的濕地生態系統。
恢復重建區
位於唐島灣南岸的西側，處於港灣與外海連線處，是東線候鳥遷徙的主要棲息地，也是濕地公園內生態環境較敏感和脆弱的區域，將合理開展退漁還濕和水禽棲息地重建工程，完善海岸防護林帶，為水禽提供豐富的食物來源與良好的棲息環境。
宣教展示區
位於唐島灣南岸，將以銀沙灘生態植物園建設為重點，加強濕地花卉展示、濕地淨化水質展示、濕地文化宣教長廊等科普宣教設施與生態文化項目建設。
管理服務區
位於銀沙灘生態植物園北部區域，將建設濕地公園管理機構及相關科研監測站點，實現良好的管理、保護和服務功能。
合理利用區
主要是唐島灣北岸區域，將重點開展生態旅遊，完善濕地生態休閒項目與服務接待設施。
