創建背景
隨著近年經濟、社會快速發展，為進一步滿足畜牧獸醫事業發展的科技需求，改善科研條件，2004年初，啟動了省級重點實驗室建設。2005年11月，經省科技廳、財政廳批准，將原“山東省動植物免疫與病蟲害分子控制重點實驗室”更名為“山東省畜禽疫病防治與繁育重點實驗室”並通過驗收，依託畜牧獸醫研究所管理。
經過近半個世紀的科研實踐與積累，畜牧獸醫研究所已發展成為全國同類研究所中學科齊全、科技力量雄厚、科研設施先進、創新能力較強、創新水平較高、科技成果豐碩、綜合實力較強、在國內具有廣泛影響的省級一類科研機構，為全省乃至全國畜牧獸醫事業的發展做出了突出貢獻。
機構設定
設有肉牛、奶牛、養豬、養羊、養兔、動物營養、獸醫、畜產品加工8個專業研究室及科研、行政辦公室；建有山東省農業高新技術示範園—畜牧示範區一處，內建有山東省良種豬繁育工程技術中心（原種豬場）、肉羊研究中心、良種奶牛擴繁場、良種兔繁育場，成為科研試驗、成果轉化、技術推廣的現代畜牧業綜合示範基地；還設有試驗添加劑廠、乳產品加工廠；合資、合作組建了山東省農科苑畜牧發展中心、山東科源畜牧良種有限公司2個獨立法人資格的有限責任公司。山東省畜牧獸醫學會家兔專業委員會、山東省畜牧獸醫學會養豬專業委員會掛靠畜牧獸醫研究所。
人才隊伍
2005年底，職工總數160人，其中在職職工105人。一線科技人員中：副高級職稱以上專業技術人才37人，中級24名；本科以上學歷49人，其中博士2人，在讀博士4人，碩士24人，研究生以上學歷占從事科技活動人員總數的31%。享受國務院特殊津貼11人，山東省專業技術拔尖人才1人，兼職院士1人，山東省良種產業化首席專家3人。形成了一支以中青年高級研究人員為主體的科研團隊，極大增強了科研創新能力、提升了創新水平。
研究領域
以山東省畜禽疫病防治與繁育重點實驗室為依託，以畜禽疫病防治與診斷、畜禽良種繁育與改良、胚胎工程技術、微生物工程、動物營養調控為重點研究方向。重點實驗室配有病原分離鑑定系統、微生物發酵和酶學檢測系統、進口顯微作業系統等國際最先進的儀器設備，可滿足病原分離鑑定、胚胎切割、顯微注射、飼料營養成分分析、畜產品質量檢測等領域科學研究的需要。
科研成果
承擔國家科技攻關計畫、農業部建設項目、山東省農業良種工程、省自然基金等各類項目23項。先後獲科研成果78項，其中省部級以上獎勵63項。在肉牛、肉羊、良種豬、飼料資源開發、奶牛胚胎移植、畜禽疾病診斷技術等多個領域處於國內先進水平。其中“商品肉牛綜合技術研究與開發”獲山東省科技進步一等獎和國家“九五”科技攻關優秀科技成果獎，“山東優質肉牛生產技術體系試驗示範項目”被評為國家農牧漁業豐收一等獎。“牛性比控制技術研究”和“瘦肉豬配套系飼養新技術研究”獲山東省科技進步二等獎。先後榮獲農業部“七五”、“八五”、“農業部科研機構綜合科研能力優秀單位”，“八五”“全國農業科研開發綜合實力百強所”稱號。
