病原
苗期染病種子帶菌嚴重的不能發芽，輕者能發芽，但幼芽脫離種皮後即死在土中；有的雖能發芽出苗，但生長細弱。幼苗染病後在芽鞘上產生黃褐色至褐黑色梭形斑，邊緣清晰，中間稍褪色，擴展後引起種根基部、根間、分櫱節和莖在部褐變，病組織逐漸壞死，上生黑色霉狀物，最後根系朽腐，麥苗平鋪在地上，下部葉片變黃，逐漸黃枯而死。成株期染病 葉片上出現梭形小褐斑，後擴展為長橢圓形或不規則形淺褐色斑，病斑兩面均生灰黑色霉，病斑融合成大斑後枯死，嚴重的整葉枯死。葉鞘染病 產生邊緣不明顯的雲狀斑塊，與其連線葉片黃枯而死。小穗發病出現褐斑和白穗。
病原 Fusarim graminearum Schw.稱禾穀鐮孢、F.avenaceum (Fr.) Sacc.稱燕麥鐮孢、F.culmorum (W.G.Smith) Sacc.稱黃色鐮孢。是多元性複合侵染的病害。黑龍江檢測出5種真菌，其中蠕孢占77%，鐮刀菌占23%。重慶地區小麥根腐病病菌種類較多，重慶植保站和西南農大在當地巴麥18和綿陽11號病組織和帶菌種子上分離出Fusarium oxysporum(尖孢鐮孢)、F.moniliforme(串珠鐮孢)、F.culmorum(黃色鐮孢)、F.graminearum(禾穀鐮孢)、Botrytis cinerea(葡萄孢)、Gerlachia nivalis(雪腐格氏霉)、Alternaria triticna(鏈格孢)、Rhizopus nigricans(根霉)等11種。回接後致病力強的有黃色鐮孢、尖孢鐮孢、串珠鐮孢、雪腐格氏霉、鏈格孢、葡萄孢菌等，均可引起冬小麥根腐病。
內蒙西部春麥區主要病原有Fusarium sp.稱鐮刀菌、Rizoctonia sp.稱絲核菌和Bipolaris sp.稱平臍蠕孢根腐菌、Gaeumanomyces sp.及Alternaria sp.等，引致春小麥根腐病。
傳播途徑和發病條件 病菌以菌絲體和厚垣孢子在小麥、大麥、黑麥、燕麥、多種禾本科雜草的病殘體和土壤中越冬，成為翌年小麥根腐病的初侵染源。該菌在土壤中存活2年。生產上播種帶菌種子也可引致苗期發病。幼苗受害程度隨種子帶菌量增加而加重，安侵
染源多則發病重；在種子帶菌為主的條件下，種子被害程度較其帶菌率對發病影響更大；播後溫度由10℃上升到20℃時，該病分生孢子萌發快，萌發率高，高於22℃萌發率明顯下降，35℃停止萌發。菌絲生長溫限4—37℃，菌絲生長pH範圍為pH2.7—10.3，產孢溫限11—35℃，適溫為20—24℃。生產上土壤溫度低或土壤濕度過低或過高易發病，土質瘠薄或肥水不足抗病力下降及播種過早或過深發病重。
防治方法
(1)因地制宜地選用適合當地栽培的抗根腐病的品種，春小麥可選用龍麥23號、龍輻麥7號。冬小麥可選用西農881、秦麥2號、12號，西農1376等抗根腐病品種。種植不帶黑胚的種子。
(2)提倡施用酵素菌漚制的堆肥或腐熟的有機肥。麥收後及時耕翻滅茬，使病殘組織當年腐爛，以減少下年初侵染源。
(3)採用小麥與豆科、馬鈴薯、油菜等輪作方式進行換茬，適時早播，淺播，土壤過濕的要散墒後播種，土壤過乾則應採取鎮壓保墒等農業措施減輕受害。
