小衛星DNA所屬現代詞,指的是可變數目串聯重複(variable number tandem repeat, VNTR),由15~65bp的基本單位串聯而成,總長通常不超過20kb,重複次數在群體中是高度變異的。
小衛星DNA (minisatellite DNA )又稱可變數目串聯重複(variable number tandem repeat, VNTR),由15~65bp的基本單位串聯而成,總長通常不超過20kb,重複次數在群體中是高度變異的。多態性由於重複單位之間的不平衡交換,從而產生不同等位基因,可通過雜交檢測出。 VNTR基本原理與RFLP大致相同,只是對限制性內切酶和DNA探針有特殊要求:(1)限制性內切酶的酶切位點必須不在重複序列中,以保證小衛星或微衛星序列的完整性。(2)內切酶在基因組的其他部位有較多酶切位點,則可使衛星序列所在片段含有較少無關序列,通過電泳可充分顯示不同長度重複序列片段的多態性。(3)分子雜交所用DNA探針核苷酸序列必須是小衛星序列或微衛星序列,通過分子雜交和放射自顯影后,就可一次性檢測到眾多小衛星或微衛星位點,得到個體特異性的DNA指紋圖譜。 小衛星標記的多態信息含量較高,在17一19之間。缺點是數量有限,而且在基因組上分布不均勻,這就極大限制其在基因定位中的套用。VNTR也存在實驗操作繁瑣、檢測時間長、成本高的缺點。