在MATLAB小波分析工具箱中實現小波分析的方法主要有函式法和GUI圖形界面操作法，其中函式法可以按照用戶的需要靈活的編寫可以重複利用的小波分析代碼，而圖形界面對於不擅長編寫代碼的用戶來說，使用更為方便和只管。
MATLAB的精華在於它的大量庫函式，對於小波分析來說，掌握並熟練使用小波工具箱裡面的函式，實際上就掌握了該工具箱。下面將列出小波工具箱中的各種函式及其功能。
小波工具箱函式
小波通用函式
biorfilt 雙正交小波濾波器組
centfrq 計算小波中心頻率
dyaddown 二元採樣
dyadup 二元插值
intwave 積分小波函式
orthfilt 正交小波濾波器組
qmf 鏡像二次濾波器
scal2frq 尺幅轉換為頻率
wavefun 小波尺度函式
wavefun2 二維小波尺度函式
wavemngr 小波管理函式
wfilters 小波濾波器組
wmaxlev 計算小波分解的最大尺度
小波函式
biorwavf 雙正交樣條小波濾波器
cgauwavf 復 Gaussian 小波
cmorwavf 復 Morlet 小波
coifwavf Coiflet 小波濾波器
dbaux 計算 Daubechies 小波濾波器
dbwavf Daubechies 小波濾波器
fbspwavf 復頻率 B-Spline 小波
gauswavf Gaussian 小波
mexihat Mexican hat 小波
meyer Meyer 小波
meyeraux Meyer 小波輔助函式
morlet Morlet 小波
rbiowavf 反雙正交樣條小波濾波器
shanwavf 復 Shannon 小波
symaux 計算 Symlet 小波濾波器
symwavf Symlets 小波濾波器
一維連續小波變換函式
pat2cwav 由模式構造小波
cwt 一維連續小波變換函式
一維離散小波變換的函式
分解函式
dwt 單尺度一維離散小波變換
wavedec 多尺度一維小波分解（一維多解析度分析函式）
wmaxlec 允許的最大尺度值分解
合成重構函式
idwt 單尺度一維離散小波逆變換
waverec 多尺度一維小波重構
wrcoef 對一維小波係數進行單支重構
upcoef 一維繫數的直接小波重構
分解結構工具
detcoef 提取一維小波變換高頻係數
appcoef 提取一維小波變換低頻係數
upwlev 單尺度一維小波分解的重構
dwtmode 離散小波變換擴展模式
二維離散平穩小波變換函式
swt2 二維離散平穩小波變換
iswt2 二維離散平穩小波逆變換
小波包分析
分解函式
wpcoef 小波包係數
wpdec 和 wpdec2 小波包分解
wpsplt 分解包
合成重構函式
wprcoef 重構係數
wprec 和 wprec2 全重構
wpjoin 重構包
分解結構工具
besttree 尋找最佳小波包樹
bestlevt 尋找最優完整小波包樹
entrupd 更新小波包熵
get 得到 WPTREE 對象的內容
read 讀取WPTREE 對象的值
wentropy 熵
wp2wtree 由小波包樹提取小波樹
wpcutree 截除小波包樹
