實驗實訓
建有化學實驗實訓中心、藥學實驗實訓中心和一個省級示範生物製藥實驗實訓中心、一個中央財政支持的生物製藥實訓中心建設項目（包括有4個化學實驗實訓室、電子天平室、藥物製劑實驗實訓室、藥物製劑綜合實訓室、光譜分析實驗室、色譜分析實驗室、模擬藥房、生物製藥技術實驗實訓室、藥物提取分離實訓室和藥發酵實訓室等）；並於省內外30餘企業合作建立了校外實習實訓基地。現擁有紫外分光光度計、高效液相色譜儀、氣相色譜儀、紅外分光光度計、大容量臥式恆溫搖床、低速大容量離心機、凝膠成像系統、高速冷凍離心機、PCR儀、CO培養箱等大型儀器設備，設備總值1000多萬元，可滿足教學和科研實驗的需要。
合作情況
有新安新藥研究所1個，近年來研發三類以上新藥6個。成立安徽醫專藥學系-立方藥業集團產學研理事會，與立方藥業訂單式培養藥學專業（製藥工藝設備套用方向），即製藥工藝、設備和法規三者合一的複合型、套用型人才。成立生物製藥技術專業（群）教學指導委員會，在企業的指導下制定專業人才培養方案，從而為藥廠、醫藥公司、醫院等單位培養了大批綜合素質高、實踐能力強的高素質技能型人才，畢業生受到企業的一致歡迎。
社會服務
藥學系設有職業技能鑑定辦公室，面向全省開展西藥藥劑員、化學檢驗工、醫藥商品購銷員等職業資格鑑定。我系學生在畢業前即可取得相應的職業資格證書。藥學系是安徽省藥監局掛牌的《藥學專業技術人員繼續教育基地》。
