學校擁有一支結構合理、素質良好、水平較高的師資隊伍。現在職教職醫護員工2102餘人,其中有正高職稱120人,副高職稱317人,享受政府特殊津貼49人。
學校辦學規模穩步擴大,人才培養層次逐步提升。至2007年8月底,全日制在校生8672人,其中本科7135人;專科438人;碩士研究生245人。畢業生就業率均處在省屬高校前列。建校以來為社會培養了2.1萬名醫療衛生人才。1984年至1997年與原地質礦產部聯合辦學14年,畢業生遍布全國各地。
學校辦學條件完善,服務設施完備。占地936畝,各類建築面積33.19萬平方米,擁有現代化教學樓、圖書館、實驗樓、學生公寓、學生活動中心等教學設施及多功能體育館、足球場、籃球場、排球場等體育設施。建有完備的校園計算機信息網路。
學校重視教學科學研究,教學科研儀器設備先進。現擁有省級精品課程7門,省基礎課實驗教學示範中心1個。主辦《皖南醫學院學報》、《中國臨床藥理與治療學》兩種刊物,面向國內外發行。
學校有教學(實習)醫院58所,其中附屬醫院8所(直屬附院1所)和46家專業實踐教學基地。附屬弋磯山醫院創建於1888年,是安徽省第一所西醫醫院、首批三級甲等醫院,為皖南及皖江地區的醫療、教學、科研、預防中心。
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