1925年於縣簡易師範講習班畢業，受聘任中心廟茶庵寺國小教員。時，大革命浪潮波及正陽，共產黨人孔劍舞、餘子靜等以教育界為基地傳播進步思想，開展革命活動。孫受其影響並在他們的教育培養下，於1927年6月加入了中國共產黨。孫崇榮投身革命後，積極從事革命活動。為傳播革命思想，他把油印機安置在自己家裡，自任主編，為中共正陽地下黨組織刻印檔案，印刷《正陽紅旗報》和革命傳單。當獲悉正陽縣長要沿淮河巡視的訊息後，他立即寫標語、印傳單交給地下黨聯絡站人員呂宜齋等，在皮店、朱店、潘店、大林、塗店等地張貼，揭露其貪贓枉法，欺壓人民的罪行，使縣長狼狽不堪，被迫提前返回縣城。民眾拍手稱快。同時，他先後發展了范俊哲、閔光遠、孫從聖、賀懷謹、賀懷燦、王壽山等人入黨，建立起中共中心廟支部，孫任支部書記。他還深入農村，鼓動貧苦農民組織起來，建立起“鞭桿會”、“窮人會”等農民組織，會員達二、三百人。並親自領導他們向土豪劣紳、首事先生范耀亭、姚普然進行“講公鬥爭”。揭露、清算范、姚二人貪污受賄等罪行，勒令其退出贓款1000餘銀元，包賠小麥4000餘公斤。1928年中共正陽特支建立，孫當選為特支委員。8月，中共正陽縣委建立（住地在中心廟茶庵寺國小），他當選為縣委委員，兼任中共中心廟區區委書記。不到一年時間，中心廟全區共發展黨員90餘人，建立起9個支部。1928年秋，開始組建武裝。孫崇榮以請土匪黑宏耀喝酒、吸大煙為名，在中心廟國小將黑處死，得短槍2支。派趙國乾在張祠堂打死土匪姚生等，得槍3支。派黨員梁長星、閔光遠等人智取范寨，奪豪紳地主長槍5支。年底，建立起中心廟游擊小組。次年春，孫率游擊小組在正、羅交界的江埠口，繳地方民團槍20餘支。6月，正式建立起40餘人的中心廟區農民游擊隊。並在王寨籌建造槍所（因泄密，遭敵人破壞）。1930年春，正陽縣農民游擊大隊建立。中心廟區農民游擊大隊編為第三中隊，孫任中隊長。3月，縣委書記尚伯華調離正陽，孫任代理縣委書記。6月，任縣委組織部部長。同年8月中旬，中共京漢（信陽）區特委派寇野清、鮑子寬、黃承基（正陽人）等人到中心廟，協助縣委組織中心廟武裝暴動。19日夜，寒凍、路口和中心廟的農民武裝70餘人，在中心廟朱喻莊墳場匯合後，時間已很緊迫，為保存實力，孫崇榮等人當即決定，連夜把隊伍轉移到陡溝尚田、黃魯店一帶。同龔灣武裝暴動隊伍匯合後，在當地開展游擊活動。寫標語、發傳單、印發《告全縣農民書》，鼓動民眾參加革命鬥爭，為縣委委員、陡溝區委書記田奉先等被害烈士報仇雪恨。他們殲滅了陡溝著名劣紳馮華閣的地方武裝，包圍了馮的住宅。馮倉皇逃跑，不久得病身亡。9月底，紅一軍許繼慎部轉戰陡溝，全殲國民黨陸軍新編十二師袁英的一個補充團。匯集此地的白狗廟、龔灣、中心廟三支農民武裝計400餘人，加入了紅一軍。初編為紅一軍先遣總隊，金克清任總隊長，孫崇榮任臨時政委。11月，改編為紅二十九軍（亦稱游擊總隊），張虎智（確山人）任軍長，孫任政委。1931年3月，編入紅四軍十師二十九團，孫仍任政委。在此期間，孫崇榮等人曾率領部隊參加了鄂豫皖蘇區二、三次反圍剿戰爭。1931年冬張國燾推行左傾路線，在鄂豫皖蘇區黨政軍中搞“大肅反”，給 孫崇榮定為所謂“改組派”。不久，在安徽省六安縣麻布街李圍孜村，將其殺害。解放後，正陽縣人民政府給孫崇榮平了反，並追認他為革命烈士。
