兄弟姐妹
秦始皇見於史書有名可考的子女只有長子扶蘇，少子胡亥、公子高、公子將閭四人。有史書說秦始皇有12個兒子，史書中還有秦始皇第10個女兒被殺的記載，這樣看來，秦始皇至少有兒女二三十人。據專家考證，秦始皇共有子女33人。
秦始皇的33位子女，除胡亥在趙高、李斯合謀下篡得皇位，做了秦二世，其餘32人皆死於非命。
長子扶蘇被篡改的遺詔賜死，胡亥復稱帝後，怕其兄長不滿而殘酷殺戮他們。史書記載的有：將六公子戮死於杜，將十二公子殺戮於鹹陽市。公子高準備逃跑，又恐家屬被誅，只好上書，請求為秦始皇殉葬，胡亥準其請求，公子將閭昆弟3人，被迫拔劍自刎，胡亥不僅處死了他所有的哥哥，對其姐妹也不放過，史書記載：胡亥將十公主戮死於杜。就這樣，胡亥為保住自己的皇位，殘酷地殺害了自己眾多的兄長姐妹。
相關記載
史書記載：秦始皇在第五次巡遊天下途中病死於河北沙丘，內宦趙高脅迫重臣李斯纂改詔書，賜死遠在北境抵禦匈奴的皇長子扶蘇和名將蒙恬，將昏庸無能的幼子胡亥扶上帝位。
趙高等雖如願以償地實現了計畫，但也深知沙丘的陰謀是不能瞞天過海的，遠在京城的諸位公子及大臣們盡皆疑惑。為剷除異己、把持朝政，於是他向秦二世建議，要“滅大臣而遠骨肉”，這種殘酷的殺戮行動從秦二世登基的當年就開始了。
秦二世元年春，國家重臣蒙毅等無辜被誅，一時間，腥風血雨遍及朝廷內外。皇室內部，有12位公子被百般凌辱後腰斬於鹹陽街市，10位公主被活活地肢解；他們的財物被盡數沒官，受株連而治罪者不可勝數。
考古發現
1976午10月，在秦陵東側上焦村附近發現了一組陪葬墓群，共17座，考古工作者發掘了其中8座，8座墓中各有一棺一停；其中7座墓中各有人骨一具，五男二女。一座墓中，棺內只有一把青銅劍，未有人骨。
令人不可思議的是棺中屍骨非常零亂，有的軀體與四肢相分離，有的頭骨與軀幹相分離，有的頭骨上有箭頭，這些現象表明墓主系非正常死亡。但同時令人不可思議的是，墓中的隨葬品非常豐富，計有金、銀、銅、鐵、陶、玉、蚌、貝、骨、漆器及絲綢殘片二百餘件，這種規格說明墓主人是有一定身份的。這些有一定身份而又遭到殘酷殺害的墓主都葬在陵園附近，說明他們必然與陵園陪葬有關。這使人聯想到被殘酷殺害的秦始皇子女。
在發掘過程中，人們在墓坑裡還發現了挖墓人烤火的遺蹟。這說明當時天氣很冷，這與胡亥誅殺諸公子的時令相吻合。因此，專家分析，這些墓葬的主人很可能是秦始皇的兒女，在發掘中還發現了兩枚私印，一枚“榮祿”，出土於男性墓中，一枚印文為“陽滋”，出土於女姓墓中。陰嫚銅印，為三層台形，橋紐，陰刻小篆。如果惟斷正確，則“榮祿”是秦始皇兒子的名字，“陽滋”是秦始皇女兒的名字。隨著挖掘深人，人們將取得更多的證據，到時秦始皇子女下落之謎有可能被徹底解開。
史書記載
胡亥登上帝位之前就害死了自己的長兄扶蘇。胡亥和趙高、李斯一起偽造了詔書送到在北面邊境戍守的扶蘇和蒙恬處，假詔書斥責扶蘇和蒙恬戍邊十幾年，不但沒立戰功，相反還屢次上書肆意非議朝政。扶蘇更是對不能回京城做太子而耿耿於懷、怨恨不已，所以對扶蘇賜劍自刎。蒙恬對扶蘇的行為不進行勸說，實為對皇帝不忠，也令自盡。
扶蘇聽了詔書，流著淚想要自刎，蒙恬畢竟比他有些經驗，勸他向皇上申訴，如果屬實再自刎也不晚，但扶蘇卻說：“父皇讓我死，還有什麼可申訴的呢？”說完含淚自盡。而蒙恬卻據理力爭，不肯自裁，使者見他不聽從詔命，就將他投入陽周（陝西子長北）的監獄裡。
做皇帝後，對其他眾多的兄弟姐妹更是殘忍有加，毫無人性。
胡亥屠殺自己兄弟最殘忍的是在鹹陽市（市即古代城市中的商業區）將十二個兄弟處死。另一次在杜郵（今陝西鹹陽東）又將六個兄弟和十個姐妹碾死，刑場慘不忍睹。將閭等三人也是胡亥的兄弟，最終也被逼自盡。他們三個人比其他兄弟都沉穩，胡亥找不出什麼罪名陷害，就關在了宮內。等其他許多的兄弟被殺後，趙高派人逼他們自盡，將閭他們對來人說：“宮廷中的禮節，我們沒有任何過錯。朝廷規定的禮制，我們也沒有違背，聽命應對，我們更沒有一點過失，為什麼說我們不是國家忠臣，卻要我們自裁？ ”來人答道：“我不知道你們為什麼被定罪處死，我只是奉命行事。”將閭三人相對而泣，最後引劍自刎。 在胡亥的眾兄弟當中，死得名聲好一點的是公子高。他眼看著兄弟姐妹們一個接一個被胡亥迫害致死，知道自己也難逃厄運。但逃走又會連累家人，於是下決心用自己的一死來保全家人的安全。他上書給胡亥，說願意在驪山為父親殉葬。胡亥很高興，又賜給他十萬錢。 除了兄弟姐妹，胡亥對其他不聽話的文武大臣也不放過。首先迫害的是蒙恬兄弟倆，開始胡亥想繼續用他們兄弟倆，但趙高害怕他們對自己構成威脅，就向胡亥造謠說，秦始皇原來曾想立胡亥做太子，但蒙恬的兄弟蒙毅極力阻止，秦始皇這才打消了立他做太子的念頭。胡亥卻信以為真，不但沒有釋放蒙恬，還將蒙毅也囚禁在代郡（河北省蔚縣東北）的監獄中。後來，胡亥派使者逼蒙毅自盡，然後又派人到陽周的監獄中逼蒙恬自殺，蒙恬開始不肯，聲辯說要見胡亥，請他收回詔命，使者不許，蒙恬見生還無望，只得服毒自盡。
•司馬遷·《史記·卷六·秦始皇本紀第六》於是二世乃遵用趙高，申法令。乃陰與趙高謀曰：“大臣不服，官吏尚彊，及諸公子必與我爭，為之柰何？”高曰：“臣固願言而未敢也。先帝之大臣，皆天下累世名貴人也，積功勞世以相傳久矣。今高素小賤，陛下幸稱舉，令在上位，管中事。大臣鞅鞅，特以貌從臣，其心實不服。今上出，不因此時案郡縣守尉有罪者誅之，上以振威天下，下以除去上生平所不可者。今時不師文而決於武力，願陛下遂從時毋疑，即群臣不及謀\。明主收舉餘民，賤者貴之，貧者富之，遠者近之，則上下集而國安矣。”二世曰：“善。”乃行誅大臣及諸公子，以罪過連逮少近官三郎，無得立者，而六公子戮死於杜。
•司馬遷·《史記·卷八十七·李斯列傳第二十七》二世燕居，乃召高與謀事，謂曰：“夫人生居世間也，譬猶騁六驥過決隙也。吾既已臨天下矣，欲悉耳目之所好，窮心志之所樂，以安宗廟而樂萬姓，長有天下，終吾年壽，其道可乎？”高曰：“此賢主之所能行也，而昏亂主之所禁也。臣請言之，不敢避斧鉞之誅，願陛下少留意焉。夫沙丘之謀，諸公子及大臣皆疑焉，而諸公子盡帝兄，大臣又先帝之所置也。今陛下初立，此其屬意怏怏皆不服，恐為變。且蒙恬已死，蒙毅將兵居外，臣戰戰慄栗，唯恐不終。且陛下安得為此樂乎？”二世曰：“為之奈何？”趙高曰：“嚴法而刻刑，令有罪者 相坐誅，至收族，滅大臣而遠骨肉；貧者富之，賤者貴之。盡除去先帝之故臣，更置陛下之所親信者近之。此則陰德歸陛下，害除而奸謀塞，群臣莫不被潤澤，蒙厚德，陛下則高枕肆志寵樂矣。計莫出於此。”二世然高之言，乃更為法律。於是群臣諸公子有罪，輒下高，令鞠治之?。殺大臣蒙毅等，公子十二人僇死鹹陽市，十公主矺死於杜，財物入於縣官，相連坐者不可勝數。
•司馬遷·《史記·卷六·秦始皇本紀第六》公子將閭昆弟三人囚於內宮，議其罪獨後。二世使使令將閭曰：“公子不臣，罪當死，吏致法焉。”將閭曰：“闕廷之禮，吾未嘗敢不從賓贊也；廊廟之位，吾未嘗敢失節也；受命應對，吾未嘗敢失辭也。何謂不臣？願聞罪而死。”
•司馬遷·《史記·卷六·秦始皇本紀第六》使者曰：“臣不得與謀，奉書從事。”將閭乃仰天大呼天者三，曰：“天乎！吾無無罪！”昆弟三人皆流涕拔劍自殺。 無罪！”昆弟三人皆流涕拔劍自殺。罪！”昆弟三人皆流涕拔劍自殺。
•司馬遷·《史記·卷八十七·李斯列傳第二十七》公子高欲奔，恐收族，乃上書曰：“先帝無恙時，臣入則賜食，出則乘輿。御府之衣，臣得賜之；中廄之寶馬，臣得賜之。臣當從死而不能，為人子不孝，為人臣不忠。不忠者無名以立於世，臣請從死，願葬酈山之足。唯上幸哀憐之。”書上，胡亥大悅，召趙高而示之，曰：“此可謂急乎？”趙高曰：“人臣當憂死而不暇，何變之得謀！”胡亥可其書，賜錢十萬以葬。
•司馬遷·《史記·卷六·秦始皇本紀第六》宗室振恐。群臣諫者以為誹謗，大吏持祿取容，黔首振恐。
•司馬光·《資治通鑑·卷第七·秦紀二》高曰：“此賢主之所能行，而昏亂主之所禁也。雖然，有所未可。臣請言之：夫沙丘之謀，諸公子及大臣皆疑焉；而諸公子盡帝兄，大臣又先帝之所置也。今陛下初立，此其屬意怏怏皆不服，恐為變。臣戰戰慄栗，唯恐不終，陛下安得為此樂乎！”
