個人經歷
1981年至1988年在北京師範大學物理學系學習，獲得理學學士和理學碩士學位，畢業後留校任教，2002年獲理學博士學位（北京師範大學物理學系與中科院物理所聯合培養）。
歷任北京師範大學物理系主任助理、科學技術處副處長、物理系副系主任、教務處副處長兼招生辦公室主任、教務處處長兼招生辦公室主任、教務處處長。
主要研究
主要研究領域為實驗凝聚態物理，發表各類論文60餘篇（其中SCI論文30餘篇，中文學術論文近30篇，中文教研論文5篇），主持或參與各類研究項目10餘項。主要社會學術兼職有中國高等教育學會理科教育專業委員會常務理事，《高等理科教育》雜誌編委，《中國大學教學》雜誌審稿專家，甘肅省教育體制改革專家諮詢委員會委員，普通高等學校本科教學評估專家等。2012年獲北京市高等教育教學成果獎一等獎，2008年獲北京市普通高等學校優秀教學管理人員稱號。
違規保研事件
根據中央紀委駐國家民委紀檢組《關於移送孟新洋案件有關人員違紀問題線索的函》，2016年2月，校紀委查處了教務處原處長白薇、教務處原副處長張焰、音樂學院原黨總支書記宋傑等人的違紀案件。該檔案通報稱，經查，音樂學院2008級音樂表演專業學生趙某桐不符合免試推薦條件。趙某桐及其家屬“通過時任北京師範大學教務處處長的XXX疏通中央民族大學教務處有關領導，違規操作，追加保研指標，幫忙免試保送至中國人民大學藝術學院就讀研究生”。
澎湃新聞記者查詢公開資料發現，事發時的北師大教務處處長為塗清雲，現任北師大珠海分校校長。澎湃新聞記者通過塗清雲秘書多次聯繫塗清雲本人，其均拒絕評論此事。
2016年6月30日，塗清雲還曾接受南方日報專訪，談及大學之道。“大學之‘大’的根本，不在於大樓之大，而在於其‘大’氣，即精神之大、責任之大。”
