培訓中心主要職能是:負責組織三峽庫區有關縣、處級以上移民管理幹部和移民系統關鍵崗位人員的培訓;負責組織三峽庫區省、地、縣三級移民部門開展移民培訓工作;負責監督和指導三峽庫區開展移民技能培訓工作;協助辦有關業務部門加強和監督移民培訓經費的使用和管理工作;負責制訂和下達三峽庫區開展移民培訓工作調研,為領導和機關提供決策依據;完成領導交辦的其他有關工作事宜。2002年10月,在原有職能的基礎上,增加負責辦機關有關信息系統網路建設和服務管理工作的職能,中心正式開始對國務院三峽工程建設委員會政府網站進行籌建。
中心自成立以來截止到目前,共舉辦移民管理幹部培訓班29期,培訓各級各類移民幹部1400多人次,內容涉及移民政策法規、移民資金管理、移民規劃管理、移民工程監理、移民外遷管理、移民檔案管理、移民工程稽察和招商引資、地質災害防治,淹沒搬遷企業結構調整,以及移民局長綜合素質培訓等;協調督導庫區省、市、縣三級舉辦各類移民幹部培訓班386期,累計培訓各級移民幹部和專業人員達1.9萬人次;規劃指導庫區基層開展移民技能培訓達1 3萬人次。