建國後,歷任東北人民政府文教委員會副主任、大連大學和東北人民大學校長、中國科院哲學社會科學部委員、中共中央歷史問題研究委員會委員、中共中央高級黨校教授。是第一屆全國人大代表、第三屆全國政協委員、中央民族事務委員會委員。 1993年8月30日呂振羽史學研討會在北京舉行,同日呂振羽陳列室在北京揭幕。
長期從事歷史研究,論著涉及經濟史、思想史、民族史、通史及史學方法等,是中國馬克思主義新史學的開拓者之一,有紅色教授之譽。著有:《最近世界之資本主義經濟》(上)、《中日問題批判》、《史前期中國社會研究》、《殷周時代的中國社會》、《中國政治思想史》、《簡明中國通史》、《中國民族簡史》等17種學術著作、5種史論文集。