教學工作
主講《動物學》、《生物進化》等課程，為《動物學》省級重點課程、市級精品課程負責人。曾從事過大熊貓、矮岩羊、藏馬雞等國家珍稀動物的研究，在《獸類學報》、《動物學報》等學術刊物發表論文40餘篇。目前主要從事翼手類（蝙蝠）分類、生態及保護的研究，完成國家自然科學基金項目2項，在研國家基金2項。主編出版了《中國獸類彩色圖譜（執行主編）》和《廣州野生動物》等專著、《動物學實驗》等教材，參編有《中國獸類圖鑑》和《四川獸類原色圖鑑》（負責翼手目）等，目前正在主持編研《中國動物志·哺乳綱·翼手目》一書。曾經獲得教育部和四川省政府科技進步三等獎各一項、四川省教委科技進步一等獎和三等獎各一項。曾獲得廣州市優秀教師和廣州大學首屆教學名師稱號。
主持科研項目
1. 四川翼手類多樣性及瀕危狀況的研究。國家自然科學基金（ 1998.1-2000.12）。9.5萬。主持人。
2. 中國菊頭蝠屬的分類研究。國家自然科學基金（ 2004.1-2006.12）。15萬。主持人。
3. 《中國動物志 獸綱 (第二卷) 翼手目》的編研。國家基金重大項目子課題（ 2004.9-2009.8）。10萬。主持人。
4．海南島翼手目系統分類與地理親緣關係的研究。國家自然科學基金（ 2007.1-2009.12）。28萬。主持人。
5. 中日小哺乳動物的地理親緣關係與物種多樣性進化。國家自然科學基金委（NSFC）與日本學術振興會(JSPS)雙邊合作項目(國科金外30811140092)。2008.4-2010.12。9.6萬。中方主持人。
6. 廣州地區蝙蝠的多樣性及在城市生態環境中的重要作用研究。2004年廣州市科技計畫項目（2004.7-2006.12）。15萬。主持人。
7. 廣東及港澳蝙蝠物種多樣性及遷移導致疾病傳播的研究。廣東省自然科學基金項目（No粵科基辦字[2008]5號，2008.10-2010.10）。5萬。主持人。
8. 青少年蝙蝠奧妙的探索與發現。廣州市科學技術局科普項目 2008.7-12. 主持人。
9. 中國菊頭蝠科的分類與分布研究。中科院動物研究所動物生態與進化國家重點實驗室開放基金，2009-2010年。主持人。
主編、參編專著
1. 四川獸類原色圖鑑。中國林業出版社，2000年（編寫翼手目42種，2萬字）。
2. 動物奇趣。廣州：新世紀出版社，2001年。第一。
3. 奧賽金牌之路—高中生物。廣西師範大學出版社，2002.6。副主編.
4. 中國獸類圖鑑。河南科技出版社，2005年（編寫翼手目100種，4萬字）。
5. 海南吊羅山自然保護區生物多樣性的研究。主編之一。廣東科技出版社，2006.6。
6. 動物學實驗。廣東新世紀出版社,2006.8。主編。
7. 廣州野生動物。廣州出版社，2007.8。主編。
8. 中國獸類彩色圖譜。科學出版社，2007.6。（執行主編之一）。
9. 動物學野外實習教程。華南理工大學出版社，2007.5。參編
發表論文
(部分）
余文華，吳毅，李玉春，江海聲，陳忠。海南島發現褐扁顱蝠Tylonycteris robustula分布新紀錄。廣州大學學報，2008，7（5）：30-33。（第2，通訊作者。共5人）（2008年10月出版）。
吳毅，易祖盛，張成菊，余文華，謝國忠，黃林生，戴克元。武廣鐵路修建對廣東石門台自然保護區陸生脊椎動物的影響。廣州大學學報（自然科學版），2008，7（6）：40-45。
李海燕，吳毅，易祖盛，舒琥。地方性高校動物學實驗教學體系改革與探索。高教探索，粵增刊[2008]77：38-40。
易祖盛、吳毅，張成菊，余文華，黃林生。武廣鐵路修建對廣東石門台自然保護區魚類的影響評價與保護建議。廣州大學學報（自然科學版），2008，7（2）：14-17。
許魁，吳毅，陳學梅。兩版本高中生物教材科學方法培養的比較。中國信息教育，2009，9：215-216.
吳毅、張成菊、吳清釗等。廣州地區犬蝠的食性。動物學研究，2008，29（1）：103-107（核心，第1，共4人）。（2008年2月出版）
石紅艷、劉昊、吳毅、胡錦矗.中華山蝠的生長發育及年齡估算.獸類學報,2008,28 (1):42–48.
吳毅、張成菊、余文華等。廣州市蝙蝠的多樣性及在農業生態環境中的作用研究。華南農業大學學報，2006，27（4）47-51。（核心，第1，共5人）。（2006年10月出版）
吳毅、周全、李燕梅等。廣州市越秀公園鳥類多樣性與保護對策。四川動物，2007，26（1）：210-212 。（核心，第1，共4人）（2007年2月出版）
張成菊、吳毅。廣州市民對蝙蝠和鳥類的認識及食用狀況分析。四川動物，2007，26（1）：97-100。（核心，通訊作者，第一作者為研究生）。（2007年2月出版）
吳毅等。中國蹄蝠科的分類現狀與展望。四川動物，2007，26(1)：210-212。（核心，通訊作者，第一作者為研究生）。（2007年2月出版）。
吳毅等。蝙蝠飼養技術和方法的探討。安徽農學通報。2007，13（6）：121-123。第一作者。
吳毅、張成菊、梁智文等。廣州市翼手類物種多樣性的研究。廣州大學學報，2007，6（2）：14-17。（第1，共4人）（2007年4月出版）。
