1650年9月，清軍入關時，沙俄乘機侵入我國黑龍江流域強占了尼布楚和雅克薩。居住在雅克薩城寨的達斡爾人寧死不屈，用獵槍、梭標抗擊敵人的槍炮。沙俄軍隊血洗城寨，達斡爾人有661人被殺，360人被俘虜，幸免於難者只有15人。沙俄盤踞在雅克薩修築城堡，到處燒殺搶掠，無惡不作。黑龍江流域的中國人稱沙俄侵略軍為“羅剎”，意思是“妖魔”。
清朝政府一再要求沙俄侵略者撤出中國，沙俄政府置若罔聞，並且不斷向雅克薩增兵遣將，加緊武力擴張。為了保衛祖國神聖領土不受侵犯，康熙皇帝平定“三藩叛亂”之後，於1682年春出巡東北視察防務，令理藩院侍郎明愛修墨爾根(嫩江)至雅克薩之間的驛站，到現興安鎮為25站。1685年2月，康熙皇帝命令都統彭春、副都統郎談率紅衣炮隊和數百名藤牌軍，急馳赴璦琿與黑龍江將軍薩布素會師。然後，3 000清軍，水陸並進，直抵雅克薩城，將指揮部設定於古城島上。6月23日彭春將一封用滿、俄和波蘭文字寫成的招降書交給戰俘，送進雅克薩城。沙俄侵略軍自以為城防堅固，對彭春的警告不理不睬。6月25日彭春下令炮擊雅克薩，但見炮聲隆隆，震天動地，火光沖天，沙俄侵略軍在強大攻勢的壓力下，龜縮在城內，處於被動挨打的困境。與此同時，藤牌軍戰艦密布江面上，與上游增援來的和潰逃的沙俄侵略軍奮勇拼殺，血染大江。經過激戰，沙俄侵略軍傷亡慘重，只好遣使赴清軍大營乞降。托爾布津率600餘人回尼布楚。清軍收復了雅克薩，焚毀城堡，然後撤回璦琿等地。
1685年8月，托爾布津獲悉清軍已撤走，率增援部隊再次侵占雅克薩，在城裡重築炮台，再建軍械庫和防禦工事，企圖長久盤踞雅克薩城。1686年2月，薩布素準備再次驅除侵略軍，在古城島上，“掘長塹，立土壘”，圍困敵人。7月，薩布素率大軍進抵雅克薩城下，用重炮猛轟城內敵營，開始攻城。托爾布津中炮身亡。清軍繼而在城外掘壕圍困，截斷城內水源，俄軍困守孤城，勢窮力竭，喪失了戰鬥力。800人的隊伍，最後只剩下66人，只好投降。中國取得了雅克薩自衛反擊戰的徹底勝利。
雅克薩之戰的敗訊傳到莫斯科，沙俄攝政王索菲亞公主被迫派專使赴北京，向清政府遞交國書，請求停戰。表示願意通過談判，和平解決邊界問題。1689年9月，中俄雙方代表在尼布楚談判，簽訂了《中俄尼布楚條約》。
1858年5月28日，黑龍江將軍奕山與沙俄穆拉維約夫簽訂《中俄璦琿條約》，將黑龍江以北、外興安嶺以南大片中國領土劃給沙俄，從此雅克薩易名為阿爾巴金諾，為沙俄進一步掠奪中國領土開了一個罪惡的先例。
現古城島15平方千米，島上的城堡與炮台至今還留有痕跡。1964年前，額木爾公社曾駐於島上，後為古城村，大部分土地已開墾種田。1985年春汛，發生冰凌災害，村民遷至內地，留有一棟二層樓房，矗立於島中，守望著綠油油的田地。環島岸邊喬灌叢生，森森古樹，枝枝相連，英姿挺拔，像守護的戰士。波光粼粼的江水，合抱著島嶼緩緩地流進幽遠的山谷，陣陣轟響，仿佛聽到了古戰場隆隆的槍炮聲。
