回收率是指與原水流量相關的透出水流量。
舉例：
10（m3/h）透出水與在原水流量13.3（m3/h）時75%回收率相對應，
回收率（R）=10（m3/h）×100（%）/13.3（m3/h）=75（%）反滲透系統回收率過高所會出現的隱患
系統回收率是指反滲透裝置在實際使用時總的回收率。系統回收率受給水水質、膜元件的數量及排列方式等多種因素的影響，小型反滲透裝置由於膜元件的數量少、給水流程短，因而系統回收率普遍偏低，而工業用大型反滲透裝置由於膜元件的數量多、給水流程長，所以實際系統回收率一般均在75％以上，有時甚至可以達到90％。
在某些情況下，對於小型反滲透裝置也要求較高的系統回收率，以免造成水資源的浪費，此時在設計反滲透裝置時就需要採取一些不同的對策，最常見的方法是採用濃水部分循環，即反滲透裝置的濃水只排放一部分，其餘部分循環進入給水泵入口，此時既可保證膜元件表面維持一定的橫向流速，又可以達到用戶所需要的系統回收率，但切不可通過直接調整給水／濃水進出口閥門來提高系統回收率，如果這樣操作，就會造成膜元件的污染速度加快，導致嚴重後果。
系統回收率越高則消耗的水量越少，但回收率過高會發生以下問題。
①產品水的脫鹽率下降。
②可能發生微溶鹽的沉澱。
③濃水的滲透壓過高，元件的產水量降低。
