目前，我院在職職工106人，其中教授級工程師、高級工程師28人，工程師及其他中級職稱58人，國家一級註冊建築師3人、一級註冊結構師4人、國家註冊諮詢工程師8人、國家註冊岩土工程師7人。我院技術力量雄厚，專業設定齊全，經驗、資料積累豐富，配有較強的現代化規劃設計手段、齊全的工程地質勘察試驗設備及數據採集系統，可提供水利、交通、水運、橋樑、碼頭、建築（含裝飾）、城市防洪、小區規劃設計及建（構）築物的結構、水電、給排水、暖空等專業勘測設計、工程諮詢服務。全院設四所（水利規劃設計研究所、水工結構設計所、岩土工程勘察所、建築設計所）、二室（總工程師室、辦公室）、二科（經營計畫科、財務科）、一中心（工程檢測中心）。
歷年來，我院積累了本地區豐富的規劃設計經驗，先後承擔了南通市水利發展“十一五”規劃、南通市城市水系規劃、南通骨幹河道整治與水資源最佳化調度規劃、長江北支水資源綜合整治規劃等，並得到各級專家的好評。另外還承擔了本市內外大量的長江碼頭如（日本）東麗公司化工專用碼頭（擬建）、南通港越江碼頭、天生港電廠煤碼頭、張家港市雙山客運碼頭、華洋化工專用碼頭（萬噸級）、滙豐碼頭（2.5萬噸級）等大中小型碼頭的規劃勘察設計與防洪影響評價任務。在沿江沿海地區積累較豐富的經驗，並形成了自己的特色。此外還參與了南水北調江蘇段影響工程、淮河流域災後重建工程、江蘇里下河四大港整治工程等我省重點工程的規劃設計任務，以上項目均得到有關專家和諮詢機構的好評。近年來，針對洋口港開發後出現的新問題，提出了解決洋口港內河疏港和淡水水源的新途徑，完成了洋口港區水源及水運工程及濱海平原水庫實施方案，並得到有關領導和專家的充分肯定，目前該項目已開始落實實施。
在抓全員質量意識的同時，進一步加大了軟體和設備的投入力度。2006年全院購置和更新了大量的規劃設計軟體，實現了全院CAD完全正版化，被Autodesk公司授予CAD軟體示範企業，同時還配備了勘察設計管理軟體，建成了區域網路，實現了全院各部門資料網上傳遞和資源共享，實現了管理信息化和自動化。2006年全院還配置了省內水利行業和市內岩土工程行業最先進的綜合試驗室，全部實現了試驗數據採集自動化。
